More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1195 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  100 
 
 		 159 aa  323  5e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  98.74 
 
 		 159 aa  320  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  88.05 
 
 		 161 aa  286  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  85.9 
 
 		 161 aa  275  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  80.89 
 
 		 157 aa  262  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  80.52 
 
 		 157 aa  259  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  80.52 
 
 		 157 aa  259  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  80.52 
 
 		 157 aa  259  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  80.52 
 
 		 157 aa  259  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  80.65 
 
 		 157 aa  259  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  79.87 
 
 		 157 aa  258  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1832  putative metalloprotease  80.65 
 
 		 157 aa  244  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3007  putative metalloprotease  80 
 
 		 157 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  78.71 
 
 		 155 aa  236  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  74 
 
 		 154 aa  229  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  73.33 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  76.77 
 
 		 155 aa  229  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  76.77 
 
 		 155 aa  229  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  76.77 
 
 		 155 aa  229  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  76.77 
 
 		 155 aa  229  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  76.13 
 
 		 155 aa  228  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  76.13 
 
 		 155 aa  228  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  76.13 
 
 		 155 aa  228  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  76.13 
 
 		 155 aa  228  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  76.13 
 
 		 155 aa  227  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  72 
 
 		 154 aa  224  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0994  putative metalloprotease  76.51 
 
 		 153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0176097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  66.88 
 
 		 154 aa  213  5.9999999999999996e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  66.21 
 
 		 158 aa  208  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  64.24 
 
 		 154 aa  206  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  61.33 
 
 		 155 aa  201  3e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  66.21 
 
 		 157 aa  201  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  65.52 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  61.49 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  62.76 
 
 		 153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  62.25 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  61.49 
 
 		 152 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  66.21 
 
 		 153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  59.74 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  66.21 
 
 		 153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  61.64 
 
 		 162 aa  181  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  65.52 
 
 		 153 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  64.83 
 
 		 153 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  63.51 
 
 		 153 aa  176  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  64.14 
 
 		 153 aa  176  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  64.14 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  64.14 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  64.14 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  62.16 
 
 		 153 aa  174  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  51.59 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  59.59 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  59.59 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  58.33 
 
 		 149 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  52.32 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  56.08 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  60.81 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  53.21 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  58.71 
 
 		 157 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  53.69 
 
 		 166 aa  156  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  59.59 
 
 		 157 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  58.06 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  58.9 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  53.25 
 
 		 160 aa  154  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  58.22 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  49.66 
 
 		 153 aa  153  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  60.27 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  52.98 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  56 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4842  putative metalloprotease  57.82 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  48.72 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  54.79 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  48.7 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  49.63 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  48.99 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.41 
 
 		 245 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  46.43 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  46.43 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.76 
 
 		 270 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.76 
 
 		 270 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  46.36 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  46.36 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  55.46 
 
 		 274 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.45 
 
 		 237 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.86 
 
 		 255 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  43.83 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.76 
 
 		 258 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.06 
 
 		 258 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.06 
 
 		 258 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.06 
 
 		 258 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  47.62 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  45 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  43.87 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  44.29 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  51.61 
 
 		 176 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  43.7 
 
 		 185 aa  120  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  43.75 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  39.62 
 
 		 189 aa  120  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  41.96 
 
 		 261 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>