More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2704 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  298  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  52.9 
 
 		 189 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0410  hypothetical protein  53.02 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.135617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  52.48 
 
 		 149 aa  146  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  52.41 
 
 		 149 aa  146  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  52.7 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  52.35 
 
 		 270 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  52.35 
 
 		 273 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  50.33 
 
 		 148 aa  143  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.39 
 
 		 245 aa  143  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.68 
 
 		 270 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.68 
 
 		 270 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.68 
 
 		 270 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.68 
 
 		 270 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.68 
 
 		 270 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  58.2 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.68 
 
 		 437 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  52.35 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  54.36 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50 
 
 		 270 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  52.41 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  54 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  52.05 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.97 
 
 		 255 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  52.03 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50 
 
 		 270 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  52.03 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  50.96 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3331  protein of unknown function UPF0054  51.33 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  47.97 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  48 
 
 		 258 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  47.97 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.98 
 
 		 261 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  51.16 
 
 		 261 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0628  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  50.33 
 
 		 161 aa  133  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  47.62 
 
 		 157 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  131  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  47.62 
 
 		 156 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  48.65 
 
 		 237 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  47.97 
 
 		 154 aa  130  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.98 
 
 		 258 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.98 
 
 		 258 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.98 
 
 		 258 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  48.37 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0512  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  58.62 
 
 		 255 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  51.02 
 
 		 151 aa  130  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  45.03 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  52.32 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  46 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  46.9 
 
 		 157 aa  126  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  54.23 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  48.34 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  47.3 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  45.33 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  45.33 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  49.01 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  46.26 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  49.01 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  40.67 
 
 		 157 aa  123  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  47.97 
 
 		 154 aa  123  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  49.01 
 
 		 153 aa  123  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  49.01 
 
 		 153 aa  123  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  47.62 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  40.82 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  48.61 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  45.95 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  45.95 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  45.95 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  45.95 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  45.95 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  50.97 
 
 		 166 aa  121  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  50.64 
 
 		 274 aa  120  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  50.68 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  40.14 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  44.59 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3949  hypothetical protein  53.02 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  45.89 
 
 		 161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  47.68 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  47.02 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  52.27 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  44.59 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  42.31 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  48.61 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  47.3 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  45.27 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  46.36 
 
 		 153 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  45.27 
 
 		 155 aa  116  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  45.27 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  45.27 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  45.27 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  45.27 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  45.27 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  45.27 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  45.27 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  46.36 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  44.59 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  44.59 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>