More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1971 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1971  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0626  hypothetical protein  57.14 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0872327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0590  hypothetical protein  61.84 
 
 		 155 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  49.15 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  44.85 
 
 		 159 aa  111  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  45.45 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  45.45 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  48.33 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  44.12 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  47.06 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  48.74 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  42.75 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  46.55 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  40.4 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  45.74 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  49.14 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  46.61 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  45.22 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  39.19 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  45.38 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  45.69 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  46.61 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  40 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  44.44 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  45.69 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  40.13 
 
 		 157 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.75 
 
 		 270 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.75 
 
 		 270 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.75 
 
 		 270 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.75 
 
 		 270 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.75 
 
 		 273 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.75 
 
 		 270 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.75 
 
 		 270 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  45.69 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  39.1 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  43.33 
 
 		 161 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  42.97 
 
 		 437 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  39.33 
 
 		 160 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  39.13 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1182  protein of unknown function UPF0054  45 
 
 		 161 aa  99.4  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  37.16 
 
 		 171 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  42.15 
 
 		 153 aa  98.6  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  42.19 
 
 		 261 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  43.8 
 
 		 161 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  42.19 
 
 		 261 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  40.27 
 
 		 158 aa  97.8  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  42.02 
 
 		 154 aa  97.1  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  43.97 
 
 		 154 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  34.81 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.33 
 
 		 274 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  42.5 
 
 		 161 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 		 157 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  44.83 
 
 		 151 aa  95.9  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  40.29 
 
 		 157 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  43.1 
 
 		 156 aa  95.9  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  40.29 
 
 		 157 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  40.29 
 
 		 157 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  40.29 
 
 		 157 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  40.29 
 
 		 157 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  37.58 
 
 		 168 aa  95.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  43.2 
 
 		 167 aa  95.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  41.18 
 
 		 159 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.62 
 
 		 237 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  41.18 
 
 		 157 aa  94.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  39.07 
 
 		 157 aa  94.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  41.38 
 
 		 153 aa  94.4  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  41.18 
 
 		 154 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.62 
 
 		 258 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  39.66 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.62 
 
 		 258 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.62 
 
 		 258 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40.62 
 
 		 258 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  41.88 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  43.1 
 
 		 152 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  43.1 
 
 		 152 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  92  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  42.74 
 
 		 166 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  42.24 
 
 		 149 aa  92  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  41.67 
 
 		 176 aa  91.7  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  42.74 
 
 		 166 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.67 
 
 		 270 aa  91.3  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  40.52 
 
 		 157 aa  91.3  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  40.34 
 
 		 154 aa  90.9  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  48.89 
 
 		 151 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  42.02 
 
 		 255 aa  90.5  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  40.16 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.67 
 
 		 270 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  42.24 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  42.74 
 
 		 157 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  41.38 
 
 		 154 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  38.46 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  45.54 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  34.84 
 
 		 149 aa  89  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  44.83 
 
 		 153 aa  89  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  42.74 
 
 		 157 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  39.04 
 
 		 153 aa  88.2  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  42.74 
 
 		 157 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  38.82 
 
 		 149 aa  88.2  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  45.76 
 
 		 148 aa  87.8  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  42.02 
 
 		 162 aa  87.8  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>