More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0590 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0590  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  314  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81862  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0626  hypothetical protein  90.32 
 
 
206 aa  294  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0872327  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1971  hypothetical protein  61.84 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603125  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  52.59 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  46.97 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  46.97 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  52.17 
 
 
168 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  52.17 
 
 
160 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  49.57 
 
 
137 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  49.57 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  45.69 
 
 
154 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  43.1 
 
 
161 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  43.48 
 
 
159 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  47.37 
 
 
157 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  44.63 
 
 
153 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  43.17 
 
 
162 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1182  protein of unknown function UPF0054  44.19 
 
 
161 aa  104  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  48.39 
 
 
157 aa  103  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  49.12 
 
 
154 aa  103  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  44.07 
 
 
161 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  47.01 
 
 
166 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  42.37 
 
 
161 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  52.17 
 
 
157 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  48.7 
 
 
158 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  39.75 
 
 
159 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  53.04 
 
 
157 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  53.04 
 
 
157 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  42.64 
 
 
152 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  46.03 
 
 
171 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4842  putative metalloprotease  52.17 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  39.13 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  43.28 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  48.28 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  46.96 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.3 
 
 
270 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  44.35 
 
 
161 aa  97.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.3 
 
 
270 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.3 
 
 
270 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.3 
 
 
270 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.35 
 
 
258 aa  97.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  52.17 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  42.61 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.3 
 
 
270 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.3 
 
 
270 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.3 
 
 
273 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  45.69 
 
 
154 aa  97.4  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  42.74 
 
 
261 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  42.74 
 
 
261 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  46.3 
 
 
437 aa  97.1  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  41.74 
 
 
237 aa  97.1  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  45.13 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.48 
 
 
258 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.48 
 
 
258 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  45.3 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.48 
 
 
258 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  43.8 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  51.72 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  40.44 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  45.69 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  44.72 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  49.57 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  44.44 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  43.55 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  44.72 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  44.72 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  44.72 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  44.72 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  46.49 
 
 
154 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  43.94 
 
 
149 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  48.7 
 
 
166 aa  94  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  39.46 
 
 
171 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  45.61 
 
 
176 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  38.96 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  44.44 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  42.24 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  42.15 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  44.25 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  44.26 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  44.35 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  39.32 
 
 
157 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  43.22 
 
 
274 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  39.66 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  41.03 
 
 
157 aa  90.9  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  43.1 
 
 
158 aa  90.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  41.6 
 
 
181 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  40.87 
 
 
152 aa  90.5  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  41.18 
 
 
255 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  40.15 
 
 
195 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  44.35 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  40.16 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  42.15 
 
 
190 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  44.35 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  39.06 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1832  putative metalloprotease  43.28 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  39.06 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  37.41 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  43.97 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1860  hypothetical protein  35.34 
 
 
155 aa  87.4  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  47.41 
 
 
149 aa  87.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  39.13 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>