More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3262 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 132 aa  263  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  96.21 
 
 		 132 aa  236  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  73.48 
 
 		 150 aa  196  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  74.42 
 
 		 129 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  75.44 
 
 		 114 aa  174  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  70.49 
 
 		 127 aa  170  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  66.39 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1233  hypothetical protein  61.83 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0777  hypothetical protein  56.84 
 
 		 97 aa  110  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  48.15 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  44.25 
 
 		 156 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  45.45 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  44.14 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  42.24 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  47.5 
 
 		 193 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  42.73 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  45.13 
 
 		 161 aa  89.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  43.86 
 
 		 156 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  42.73 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  40.34 
 
 		 195 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  39.84 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  40.6 
 
 		 154 aa  85.9  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  44.12 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  43.14 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  43.22 
 
 		 301 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  36.15 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  41.96 
 
 		 274 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  41.59 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  41.59 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  42.98 
 
 		 156 aa  84.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  41.23 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  43.24 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  37.21 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  39.17 
 
 		 172 aa  84  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  45.19 
 
 		 161 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  44.25 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  45.83 
 
 		 171 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  43.64 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  43.36 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  43.36 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  43.36 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  41.59 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  41.82 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  43.65 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  38.89 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  42.73 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  42.48 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  42.48 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  42.48 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  42.48 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  42.48 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  42.48 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  42.48 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  41.67 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  41.59 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  41.59 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  43.62 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  39.02 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  38.69 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  42.24 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  36.7 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  43.24 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  40.5 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  38.71 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  40.91 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  39.84 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  36.67 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  48.31 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.4 
 
 		 437 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  39.58 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.4 
 
 		 273 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40 
 
 		 258 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.4 
 
 		 270 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  35.71 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  38.28 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  38.05 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  42.22 
 
 		 200 aa  77  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  37.82 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  38.02 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  39.09 
 
 		 258 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  37.17 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  38.53 
 
 		 152 aa  76.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  39.09 
 
 		 258 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  39.09 
 
 		 258 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  41.35 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.6 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.6 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.6 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.6 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  37.6 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.6 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  37.17 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  45.74 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  37.72 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  39.62 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  39.64 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  34.09 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>