More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2284 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  230  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  86.84 
 
 		 150 aa  204  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  77.19 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  68.42 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  65.79 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  74.56 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  75.44 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1233  hypothetical protein  63.21 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0777  hypothetical protein  55.79 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  46.36 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  45.22 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  42.98 
 
 		 195 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  45.37 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  45.37 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  45.37 
 
 		 162 aa  90.5  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  45.37 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  49.44 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  46.85 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  45.87 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  44.55 
 
 		 161 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  43.56 
 
 		 161 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  41.74 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  43.36 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  43.59 
 
 		 301 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  41.12 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  42.59 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  42.34 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  40.52 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  47.67 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  43.56 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  43.01 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  43.27 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  42.73 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  43.52 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  41.67 
 
 		 168 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  41.51 
 
 		 167 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  45.05 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  44.14 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  44.14 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  34.55 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  37.72 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  44.14 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  44.14 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  44.14 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  44.83 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  44.14 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  44.14 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  42.34 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  44.14 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  44.14 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  37.74 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  42.11 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  47.62 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  42.59 
 
 		 171 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  42.73 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  42.73 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  40.59 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  40.65 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  45.54 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  40.95 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  41.67 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  44.44 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  43.68 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  40.54 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  40.54 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  43.16 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  45.05 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  41.51 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  43.16 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  43.27 
 
 		 193 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  40.57 
 
 		 176 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  38.24 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  39.5 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  37.25 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  45.35 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  36.7 
 
 		 202 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  39.62 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  41.67 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  39.53 
 
 		 163 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  41.38 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  43.82 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  41.96 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  38.94 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  45.12 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  34.82 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  38.33 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40 
 
 		 258 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  38.74 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  45.26 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  37.04 
 
 		 158 aa  70.1  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  37.17 
 
 		 185 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  44.74 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  40 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  38.74 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  34.4 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  36.11 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  39.09 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>