More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0576 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
161 aa  322  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  51.88 
 
 
162 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  44.31 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  44.65 
 
 
158 aa  138  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  43.71 
 
 
168 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  42.14 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  47.17 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  41.61 
 
 
155 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  40.37 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  44.06 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  40.13 
 
 
446 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  41.72 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  41.72 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  42.58 
 
 
156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  42.57 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  42.41 
 
 
157 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  39.35 
 
 
301 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  45.07 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  43.67 
 
 
165 aa  107  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  44.37 
 
 
156 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  43.66 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  43.66 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  43.66 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  43.66 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  43.66 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  43.66 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  43.66 
 
 
156 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  40.25 
 
 
156 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  43.66 
 
 
156 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  41.67 
 
 
156 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  39.49 
 
 
156 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  39.26 
 
 
142 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.25 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  34.42 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  37.89 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  39.04 
 
 
160 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  41.86 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  36 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  39.74 
 
 
165 aa  92.4  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  35.71 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  37.42 
 
 
160 aa  90.9  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  42.75 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  34.59 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  30.86 
 
 
176 aa  89  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  35 
 
 
169 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  34.69 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  35.71 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  34.69 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  41.67 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  32.89 
 
 
201 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  37.84 
 
 
160 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  34.69 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  34.69 
 
 
177 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  34.69 
 
 
177 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  34.69 
 
 
177 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  35.53 
 
 
149 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  33.8 
 
 
183 aa  87  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1814  hypothetical protein  40.17 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.28628  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  40.83 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  41.59 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  37.16 
 
 
160 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
160 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  40 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  34.87 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  39.13 
 
 
167 aa  85.1  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  37.12 
 
 
149 aa  85.1  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  37.21 
 
 
155 aa  85.1  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  37.5 
 
 
168 aa  84.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  39.32 
 
 
155 aa  84.3  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  33.81 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  32.3 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  39.37 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  35.65 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  32.28 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  34.46 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  33.11 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  39.84 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  31.76 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  39.13 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  36.51 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  32.62 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  39.31 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  41.38 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  33.55 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  39.84 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  39.5 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  40.52 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  36.67 
 
 
411 aa  80.9  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  35 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.79 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  37.39 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  32.62 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  39.46 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  33.79 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  35.25 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1200  protein of unknown function UPF0054  42.07 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00136403  normal  0.462097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  37.04 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  33.13 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  37.1 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>