More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0736 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  324  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  56.25 
 
 
160 aa  183  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  50.91 
 
 
162 aa  154  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  48.73 
 
 
156 aa  142  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  47.17 
 
 
156 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  46.99 
 
 
165 aa  137  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  47.13 
 
 
161 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  48.05 
 
 
156 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  48.05 
 
 
156 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  46.25 
 
 
153 aa  135  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  47.4 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  47.4 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  47.4 
 
 
156 aa  133  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  47.4 
 
 
156 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  47.4 
 
 
156 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  47.4 
 
 
156 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  47.4 
 
 
156 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  47.4 
 
 
156 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  47.4 
 
 
156 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  46.1 
 
 
156 aa  130  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  44.81 
 
 
155 aa  125  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  47.48 
 
 
157 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  49.33 
 
 
156 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  47.22 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  44.59 
 
 
157 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  39.35 
 
 
156 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  47.66 
 
 
158 aa  105  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  46.34 
 
 
160 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  44.72 
 
 
159 aa  97.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  36.55 
 
 
175 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  38.96 
 
 
165 aa  94.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.19 
 
 
155 aa  94  7e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  39.72 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.54 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  35.53 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  34.84 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  40.48 
 
 
180 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  36.17 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  45.95 
 
 
142 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  41.18 
 
 
178 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  42.15 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  36.77 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  35.92 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  39.34 
 
 
183 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  41.98 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  32.5 
 
 
168 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  37.78 
 
 
170 aa  87.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  36.13 
 
 
151 aa  87  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  38.13 
 
 
169 aa  87  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  38.57 
 
 
446 aa  87  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  34.38 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  31.61 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  31.61 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  31.61 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  39.26 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  39.68 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  35.61 
 
 
167 aa  84.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  32.24 
 
 
186 aa  84.3  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  37.12 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  46.39 
 
 
174 aa  84  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  31.25 
 
 
168 aa  84  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  40.5 
 
 
301 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  39.34 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  35.61 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  30.32 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  32.26 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  34.33 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  30.97 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  34.19 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  39.5 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  40.16 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  37.82 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.64 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  36.69 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  32.91 
 
 
173 aa  80.5  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  32.48 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  34.59 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  40.43 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  35.07 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  40.16 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  37.7 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  30.97 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  40.31 
 
 
411 aa  79  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  33.55 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  34.27 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  38.33 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.37 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  35.51 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  37.12 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  35.21 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  35.54 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  35.43 
 
 
183 aa  77  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1814  hypothetical protein  36.75 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.28628  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  37.4 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  37.12 
 
 
150 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  32.26 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.59 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>