More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1250 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  100 
 
 		 187 aa  370  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  78.86 
 
 		 183 aa  280  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  70.47 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  58.19 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  58.19 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  58.19 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  59.17 
 
 		 184 aa  204  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  59.76 
 
 		 178 aa  204  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  62.72 
 
 		 182 aa  202  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  64.37 
 
 		 179 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  67.53 
 
 		 157 aa  197  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  58.19 
 
 		 188 aa  197  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  65.58 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  59.12 
 
 		 155 aa  184  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  57.56 
 
 		 164 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  60.26 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  59.6 
 
 		 167 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  58.67 
 
 		 156 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  58.55 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  60.39 
 
 		 153 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  60 
 
 		 150 aa  175  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  57.79 
 
 		 160 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  55.33 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  58.62 
 
 		 153 aa  171  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  56.86 
 
 		 159 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  58.55 
 
 		 162 aa  167  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  60.69 
 
 		 150 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  56.67 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  54.14 
 
 		 173 aa  164  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  53.16 
 
 		 157 aa  158  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  51.9 
 
 		 157 aa  157  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  55.33 
 
 		 201 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  53.33 
 
 		 166 aa  154  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  53.64 
 
 		 149 aa  151  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  42.22 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  50.98 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  49.66 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  52.9 
 
 		 157 aa  129  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  45.45 
 
 		 157 aa  92.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  36.42 
 
 		 155 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  36.42 
 
 		 155 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  36 
 
 		 446 aa  91.3  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  38.69 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  36.8 
 
 		 155 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.52 
 
 		 142 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  35.29 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  41.23 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  38.6 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  39.64 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  33.55 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  36.61 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  39.64 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  39.64 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  39.64 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  39.64 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  39.64 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  39.64 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  32.82 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  39.64 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  39.64 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  34.31 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  38.74 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  33.76 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  34.56 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  32.35 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  33.95 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  34.67 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  43.59 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  37.84 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  35.4 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  36.05 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  37.98 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  36.11 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1509  hypothetical protein  35.26 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728436  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  37.23 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  36.89 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  29.73 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  41.75 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  40.57 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  39.47 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  38.18 
 
 		 154 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  39.47 
 
 		 158 aa  72  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  34.69 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  34.69 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.45 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  31.75 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  39.29 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  31.87 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  35.38 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  32.26 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  39.29 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  31.71 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  29.73 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  35.78 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  37.84 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  27.07 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  29.03 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  33.1 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  38.33 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>