More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1509 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1509  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  271  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2850  protein of unknown function UPF0054  40.85 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  34.92 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  35.26 
 
 		 187 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  37.74 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  37.74 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  37.74 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  33.78 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  31.37 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  37.74 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  37.74 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  33.76 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  36.21 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  35.85 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  30.57 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  32.56 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  36.7 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  33.12 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  31.62 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  31.41 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  34.64 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  39.22 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  35.85 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  40.52 
 
 		 301 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  34.91 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  35.1 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  38.52 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  33.77 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  32.46 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  32.76 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  32.43 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  35 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  35.92 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  39.62 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  35.17 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  38.46 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  33.96 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  32.43 
 
 		 184 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  33.03 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  34.91 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  33.03 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  30.89 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  33.91 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  34.58 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  31.76 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  36.79 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  31.76 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  31.76 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  31.13 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  34.62 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  33.93 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  35.4 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  31.76 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  28.28 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  28.28 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  31.71 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  32.08 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.62 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.04 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  31.51 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  36.7 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  30.07 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  35.88 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  37.74 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  29.79 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  29.8 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  37.08 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  40 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  33.96 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  32.33 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  37.08 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  37.74 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  38.37 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  31.29 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  38.37 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  36.05 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  31.3 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  38.37 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  38.37 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  38.37 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  33.33 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  29.87 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  31.17 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  29.94 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  33.33 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  32.65 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  32.54 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  29.82 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  33.91 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  33.33 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  31.3 
 
 		 237 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1067  protein of unknown function UPF0054  37.38 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  32.08 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  37.23 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  36.28 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  35.65 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  29.22 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  33.93 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>