More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1403 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  301  3.0000000000000004e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  91.33 
 
 
150 aa  275  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  48.82 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  43.22 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  35.43 
 
 
143 aa  87  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  43.48 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  33.85 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  36 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  36.97 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  35.38 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  39.78 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  34.17 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  40.45 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  31.82 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  39.6 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  37.4 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  37.4 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  35.09 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  35.54 
 
 
446 aa  74.3  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  31.29 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  31.29 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  32 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  37.86 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  36.07 
 
 
161 aa  72  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  39.05 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  35.61 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  37.63 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  33.33 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  37.1 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  40.43 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  33.07 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  41.49 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  37.63 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.08 
 
 
237 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  32.73 
 
 
195 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  34.86 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  37.86 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  40.43 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  38.14 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  38.14 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  41.49 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  31.82 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  32.85 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.43 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  41.24 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  35.71 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  35.48 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.27 
 
 
270 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  29.41 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  33.93 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  35.48 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  37.04 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  35.48 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  38.32 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  35.48 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  35.48 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  35.4 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  39.36 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.27 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  39.36 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  39.36 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  39.36 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  34.48 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  30.91 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  35.92 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  39.36 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.17 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  31.58 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.17 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  34.26 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  35.29 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0994  putative metalloprotease  41.67 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0176097  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  33.33 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  32 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  37.23 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  37.93 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  31.71 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  35.29 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  35.29 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  33.98 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  36.61 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  38.61 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  32 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0512  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  33.94 
 
 
255 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  41.49 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  38.37 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  34.75 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  38.14 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  32.73 
 
 
160 aa  67  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  30.7 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  32.17 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.51 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  39.36 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  36.56 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  39.6 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  34.23 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  30 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>