180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3801 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  52.24 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  50.37 
 
 		 143 aa  147  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  46.62 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  48.91 
 
 		 138 aa  136  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  51.43 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  123  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  38.97 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  45.11 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  41.03 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  36.59 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  39.17 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  39.81 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  40.19 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  36.52 
 
 		 137 aa  84.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  38.68 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  35.34 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  27.78 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  36.79 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  41.41 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  37.93 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  40.86 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  30.52 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  32.35 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  27.63 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  30.4 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  28.57 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  29.22 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  29.22 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  29.22 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  29.22 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  29.22 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  29.22 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  35.58 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  27.63 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  31.03 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  28.91 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  31.78 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  29.2 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  29.2 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  27.41 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  27.27 
 
 		 301 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.38 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  29.47 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  30.61 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  32.79 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  32.23 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  26.85 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  26.85 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  27.73 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  35.16 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  25.89 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  31.82 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  27.88 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  28.8 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  30.97 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  32.48 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  29.21 
 
 		 168 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  31.37 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  31.71 
 
 		 446 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  27.43 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  32.35 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  26.32 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  29.52 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  35.8 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  35.8 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  28 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  26.47 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  27.78 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  24.65 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  29.27 
 
 		 245 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  27.19 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  26.9 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  29.09 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  32.95 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  27.27 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  28.7 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  27.61 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  30.53 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  29.36 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  27.38 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  25.35 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  24.76 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  23.58 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  32.14 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  25.96 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  28.71 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  29.9 
 
 		 274 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0628  hypothetical protein  30.21 
 
 		 153 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  29.7 
 
 		 255 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  24.79 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  23.81 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  25.93 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  29.29 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  26.14 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  27.36 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  23.81 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.43 
 
 		 270 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  28.85 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>