136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1173 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  328  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  56.74 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  57.04 
 
 		 137 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  55.38 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  53.28 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  54.01 
 
 		 142 aa  156  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  52.27 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  39.69 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  41.03 
 
 		 146 aa  97.1  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  42.48 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  36.8 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  36.52 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  37.38 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  37.7 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  36.89 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  32.58 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  39.13 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  38.21 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  36.26 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  27.27 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  28.67 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  29.25 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  28.38 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  33.64 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  35.58 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  33.02 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  41.18 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  34.02 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  36.28 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  30.33 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  33.01 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  26.05 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  26.47 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  27.35 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  33.02 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  24.83 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  25.93 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  25.56 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  25 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1155  hypothetical protein  26.96 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.8201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  29.75 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  25.83 
 
 		 446 aa  51.6  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  31.33 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  27.48 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  25.5 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  27.52 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  32.08 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  24.09 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  27.03 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  34.78 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  32.38 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  26.61 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  27.59 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  28.32 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  28.18 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  28.87 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  32.35 
 
 		 193 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  24.46 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  33.98 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  27.36 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  26.79 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  30.34 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0927  hypothetical protein  26.8 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  27.87 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  24.64 
 
 		 245 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.36 
 
 		 261 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  24.77 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  23.36 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.36 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.36 
 
 		 261 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  27.68 
 
 		 274 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1233  hypothetical protein  40.68 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  23.36 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  24.14 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  29.25 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  29.63 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  29.7 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  29.29 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  29.29 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  26.83 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  25 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  29.29 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  29.29 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  29.29 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  29.29 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  29.29 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  23.36 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  32.04 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  36.9 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  29.29 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  31.82 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  27.27 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  26.51 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  31.82 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  24.81 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  24 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  24.81 
 
 		 258 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  24.81 
 
 		 258 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  26.83 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2850  protein of unknown function UPF0054  28.32 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>