286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1004 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  68.35 
 
 		 138 aa  193  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  57.97 
 
 		 139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  51.15 
 
 		 137 aa  136  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  44.7 
 
 		 143 aa  123  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  44.27 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  45.45 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  45.11 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  42.34 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  41.22 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  38.74 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  39.62 
 
 		 137 aa  87.4  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  39.18 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  32.58 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  41.11 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  34.71 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  39.13 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  31.67 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  35.88 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  33.57 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  34.21 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  35.07 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  32.82 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  32.65 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  26.77 
 
 		 301 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  30.53 
 
 		 157 aa  66.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  38.95 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  34 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  31.37 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  33.02 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  28.76 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  30.84 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  30.6 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  35.92 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  29.32 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  29.84 
 
 		 161 aa  62  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  32.32 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  31.07 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  31.37 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  31.37 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  34.69 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  30.7 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  35.23 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  29.06 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  30.17 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.11 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  30.17 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  28.57 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  30.7 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  30.7 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  30.7 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  30.7 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  28.57 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  28.57 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  30.7 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  30.7 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  29.69 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  28.57 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  28.57 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  27.63 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  29.91 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  31.78 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  32.17 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  33.58 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  33.64 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  29.41 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  29.32 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  28.07 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  30.84 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  26.96 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  26.92 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  29.91 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  32.56 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  25.78 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  26.8 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  28.97 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  32.71 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  30.51 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  29.32 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  32.71 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  34.07 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  28.81 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  27.05 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  32.08 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  27.67 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  27.67 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  27.27 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  31.78 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  27.03 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  31.78 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  31.78 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  30.08 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  31.78 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  28.69 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  32.08 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  31.78 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  31.78 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  34 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>