155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2127 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 139 aa  289  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  57.97 
 
 		 139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  56.52 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  55.97 
 
 		 137 aa  153  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  51.43 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  42.54 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  52.14 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  47.01 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  45.8 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  45.8 
 
 		 147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  39.69 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  36.84 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  41.82 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  43.24 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  42.99 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  35.11 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  35.14 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  39.18 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  33.94 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  30.83 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  32.48 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  36.79 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  38.4 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  33.58 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  30.77 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  32.14 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  30.46 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  29.85 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  30.46 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  34.19 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  33.65 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  29.8 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  34.03 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  41.05 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  30.46 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  30.46 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  30.46 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  30.46 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  30.46 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  30.46 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  29.14 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.02 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  38.82 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  28.44 
 
 		 301 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  27.5 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  31.3 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  31.3 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  28.08 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  37.65 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  33.64 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  34.41 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  30.08 
 
 		 446 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  25.42 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  30.97 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  26.28 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  34.41 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  29.46 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  31.58 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  25.48 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  24.81 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  25.45 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1670  protein of unknown function UPF0054  36.63 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  35.16 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  32.73 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  30.77 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  24.48 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  30.1 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  30.7 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  26.85 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  26.85 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  30.11 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  34.07 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  26.36 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  30.61 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  27.84 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  29.06 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  29.06 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  32.81 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  28.8 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  26.57 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  27.15 
 
 		 161 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  32.69 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  31 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  25.83 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  25.55 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  29.29 
 
 		 411 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  25.6 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  24.37 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  26.61 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  28.7 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  27.12 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  22.66 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  28.04 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  27.56 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  25.23 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  28.28 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  26.17 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  26.77 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>