144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1730 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  67.42 
 
 		 142 aa  190  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  67.65 
 
 		 144 aa  191  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  57.69 
 
 		 141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  55.38 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  55.3 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  54.62 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  43.24 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  33.86 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  33.85 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  34.19 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  38.68 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  44 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  41.11 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  33.09 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  36.44 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  35.24 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  37.37 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  38.71 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  33.64 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  31.3 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  32.84 
 
 		 446 aa  67.8  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  36.72 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  34.13 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  41.57 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  33.33 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  29.69 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  42.11 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  30.71 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  33.03 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  31.03 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  32.74 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  32.85 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.36 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  35.63 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  29.32 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  29.82 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  33.94 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  31.2 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  33.02 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  35.16 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  31.11 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  34.65 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  29.47 
 
 		 301 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0927  hypothetical protein  27 
 
 		 154 aa  52  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  31.03 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  33.86 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  30.23 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  35.92 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  35.92 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1155  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.8201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  34.88 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  26.37 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  27.52 
 
 		 189 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  35.35 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  34.95 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  34.95 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  34.95 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  34.95 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  27.07 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  34.95 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  34.95 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  26.67 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  31.87 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  28.28 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  30.43 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_002620  TC0705  hypothetical protein  25.76 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.276806  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  24.44 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  24.44 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  30.77 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  30.41 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  25.56 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  28.85 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  31.4 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  29.73 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  29.63 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  28.03 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  24.79 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  25.19 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  30.69 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  26.89 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  30.97 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  30.97 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  30.23 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0249  hypothetical protein  30.51 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  23.19 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  31.11 
 
 		 193 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  26.17 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  27.12 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  29.7 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  34.12 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  25 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  26.5 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  27.91 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  28.57 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  29.63 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  29.35 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  29.63 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  27.1 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>