272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1354 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  285  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  57.04 
 
 
156 aa  164  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  54.81 
 
 
142 aa  157  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  54.62 
 
 
139 aa  156  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  57.58 
 
 
144 aa  155  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  54.89 
 
 
141 aa  154  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  55.56 
 
 
138 aa  153  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  41.82 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  41.67 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  90.9  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  39.62 
 
 
139 aa  87.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  35.04 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  36.52 
 
 
146 aa  84.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  38.53 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  43.48 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  34.97 
 
 
446 aa  80.5  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  31.3 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  41.3 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  36.52 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  33.59 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  32.14 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  35.85 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  35.25 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  35.79 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  28.17 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  31.82 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  29.2 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  32.56 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  37.25 
 
 
193 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.35 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  27.74 
 
 
162 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  29.71 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  26.98 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  32.5 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  30.17 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  30.08 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  33.94 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  33.94 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  34.07 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  33.02 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  29.45 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  30.91 
 
 
152 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  30.65 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  26.67 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  25.77 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  30.91 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  27.88 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  28.67 
 
 
189 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  27.97 
 
 
165 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  31.11 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  31.4 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0927  hypothetical protein  30.39 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  29.36 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  27.35 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  32.99 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  29.01 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  31.68 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  28.86 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  29.79 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  29.77 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  30.36 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  30.63 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  29.55 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  29.73 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  32.43 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  32.43 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  32.43 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  32.43 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.36 
 
 
166 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  32.43 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  32.43 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  31.58 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  31.96 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  28.71 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  24.44 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  28.57 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  31.87 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  29.79 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  30.19 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  35.53 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  26.15 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  31.96 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  28.24 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  24.82 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  30.68 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  30 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  29.45 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  29.45 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  29.79 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  34.21 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1155  hypothetical protein  27.45 
 
 
154 aa  52  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.8201  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  28.45 
 
 
158 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  32.88 
 
 
158 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  27.52 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  34.25 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  29.09 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  33.72 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  34.25 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>