193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5558 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 137 aa  286  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  59.7 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  52.24 
 
 		 146 aa  158  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  55.97 
 
 		 139 aa  153  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  49.26 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  51.15 
 
 		 139 aa  136  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  43.7 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  43.41 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  40.44 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  36.8 
 
 		 156 aa  86.7  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  35.2 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  33.85 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  35.16 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  37.04 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  34.86 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  32.52 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  31.82 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  31.97 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  29.93 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  29.93 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  27.56 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  31.9 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  30.77 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  31.86 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  32.63 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  30.91 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  35.71 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  30.48 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  32.54 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  31.31 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  34.86 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  25.93 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  29.29 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  28.18 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  29.69 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  28.28 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  35.24 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  28.18 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  33.98 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  27.2 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  26.71 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  28.21 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  26.71 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  27.78 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  31.13 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  29.41 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  27.35 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.15 
 
 		 258 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  26.71 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  26.03 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  24.32 
 
 		 156 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  25.83 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  26.71 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  26.71 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  26.71 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  29.41 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  26.71 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  26.71 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  26.71 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  26.92 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  26.03 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  27.41 
 
 		 258 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  29.41 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  27.41 
 
 		 258 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  27.41 
 
 		 258 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  30.95 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  28.79 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  28.28 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  27.19 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  31.75 
 
 		 132 aa  50.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  30.39 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1670  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  27.78 
 
 		 245 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.79 
 
 		 261 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  27.73 
 
 		 168 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.79 
 
 		 261 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  27.72 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  31.18 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0512  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.85 
 
 		 255 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  34.07 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  30.1 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  26.83 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  27.52 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  26.17 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  28.71 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  27.35 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  36.25 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  27.1 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  27.27 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  27.1 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  32.04 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  26.19 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  22.94 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  27.56 
 
 		 237 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  28.57 
 
 		 168 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  27.97 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0628  hypothetical protein  29.7 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  24.73 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>