145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1736 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  293  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  67.42 
 
 
139 aa  190  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  63.89 
 
 
144 aa  184  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  58.82 
 
 
141 aa  167  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  54.68 
 
 
138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  54.81 
 
 
137 aa  157  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  54.01 
 
 
156 aa  156  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  38.14 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  42.99 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  33.08 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  39.81 
 
 
146 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  38.74 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  36.13 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  37.61 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  35 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  33.08 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  37.04 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  33.87 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  40.86 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  39 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  35.78 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  30.08 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  30.88 
 
 
446 aa  63.5  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  39.33 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  39.33 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  37.25 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  33.02 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  31.9 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  31.53 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  31.16 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  29.71 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  31.48 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  33.98 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.41 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  29.6 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  31.48 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  26.5 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  29.81 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  34.74 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  30.83 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  36.36 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  27.63 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  29.9 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  32.41 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  30.08 
 
 
156 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  26.06 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  24.56 
 
 
175 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  31.37 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  26.27 
 
 
152 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  30.36 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  29.63 
 
 
168 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  30.36 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  29.63 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  34.29 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  30.36 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  30.36 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  30.36 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  30.36 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  26.21 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  30.36 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  30.36 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.36 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  31.18 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0249  hypothetical protein  31.11 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  29.08 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  32.99 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  31.4 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  28.57 
 
 
202 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  31.58 
 
 
129 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  32.98 
 
 
147 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  30.12 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  27.5 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.16 
 
 
270 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  25.76 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  25 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.72 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  25.76 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  27.72 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  27.71 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  27.71 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  29.07 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  29.7 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  27.91 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  26.42 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  23.02 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  25 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  29.41 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  28.89 
 
 
157 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  24.22 
 
 
165 aa  44.3  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  29.76 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  23.53 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  27.68 
 
 
162 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  27.91 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  23.47 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  23.53 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  25.42 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  27.96 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  28.71 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  28.1 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  31.52 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>