123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1583 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 144 aa  296  6e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  67.65 
 
 		 139 aa  191  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  63.89 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  55.22 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  52.14 
 
 		 141 aa  160  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  57.58 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  52.27 
 
 		 156 aa  146  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  40.34 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  38.18 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  40.19 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  33.86 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  37.17 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  35.48 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  34.86 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  36.61 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  39.13 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  40.15 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  35.45 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  33.58 
 
 		 446 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  33.9 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  31.11 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  31.11 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  31.78 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  29.75 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  32.26 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  30.56 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  35.16 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.18 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  25.87 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  31.25 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  31.25 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  26.36 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1564  protein of unknown function UPF0054  28.72 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.27 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  29.71 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  28.42 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  31.31 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  28.81 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  27.88 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.57 
 
 		 270 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  34.94 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  24.58 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  25.21 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  27 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  27 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  27.96 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  23.73 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  31.07 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  24.58 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  28.71 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.57 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  27.78 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  28.26 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  27.97 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  28.33 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  27.08 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  32.89 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  23.73 
 
 		 258 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  30.67 
 
 		 245 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  28.83 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  25.61 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  26.55 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  27.59 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  28.17 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  23.73 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  23.73 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  23.73 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0410  hypothetical protein  25.96 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.135617 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  29.81 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  23.81 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0512  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  30.43 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  27.47 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  28.18 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  28.17 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf636  hypothetical protein  29.63 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  25 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1670  protein of unknown function UPF0054  35.14 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573559  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  30.1 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  27.43 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  28.17 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  27.41 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.09 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.09 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3331  protein of unknown function UPF0054  25.96 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.09 
 
 		 270 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.09 
 
 		 270 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  27.14 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.09 
 
 		 270 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  26.83 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.09 
 
 		 270 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  26.09 
 
 		 270 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  32 
 
 		 144 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0628  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>