127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1505 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
141 aa  292  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  60.9 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  56.74 
 
 
156 aa  169  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  58.82 
 
 
142 aa  167  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  57.69 
 
 
139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  52.14 
 
 
144 aa  160  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  54.89 
 
 
137 aa  154  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  36.84 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  33.83 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  39.17 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  40.17 
 
 
140 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  36.07 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  36 
 
 
146 aa  84.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  34.65 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  35.16 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  34.71 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  39.81 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  36.94 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  34.02 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  31.82 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  33.58 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  43.18 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  43.18 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  34.95 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  31.78 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.78 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  33.03 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  39.74 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  29.92 
 
 
258 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  26.05 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  32.35 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  30.47 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  28.68 
 
 
446 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  27.19 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  31.86 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  32.1 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  29.27 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  29.13 
 
 
258 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  29.13 
 
 
258 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  29.13 
 
 
258 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  26.85 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  27.56 
 
 
237 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.23 
 
 
261 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  28.07 
 
 
128 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  28.23 
 
 
261 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  23.18 
 
 
188 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  25.42 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  29.7 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  27.55 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  30.23 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  27.84 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  25 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  31.69 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  27.97 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  31.18 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  25.41 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0927  hypothetical protein  27.16 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  31.69 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  25 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  26.67 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  25.49 
 
 
301 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  25.26 
 
 
149 aa  47.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  27.78 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  28.45 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  28.47 
 
 
156 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  28.47 
 
 
156 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  28.47 
 
 
156 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  23.53 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  28.47 
 
 
156 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  28.18 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  28.18 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  27.43 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  28.47 
 
 
156 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  27.43 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  28.47 
 
 
156 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  21.94 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1155  hypothetical protein  25.26 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.8201  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  23.97 
 
 
162 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  29.46 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  23.4 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  23.57 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  28.23 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  26.55 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  28.7 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  27.91 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  33.78 
 
 
180 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  26.55 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  29 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  23.01 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  23.01 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  29.9 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  40.3 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  24.39 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  27.17 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  22.86 
 
 
170 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  28.57 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  24.81 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  23.88 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  25.69 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  21.85 
 
 
148 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>