More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3068 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  100 
 
 
154 aa  310  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  54.9 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  54.68 
 
 
157 aa  140  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  49.66 
 
 
301 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  43.67 
 
 
158 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  45 
 
 
159 aa  130  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  51.13 
 
 
157 aa  127  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  41.1 
 
 
162 aa  124  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  50.44 
 
 
154 aa  120  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  41.67 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  42.31 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  41.03 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  46.79 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  45.99 
 
 
159 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  49.57 
 
 
142 aa  117  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  46.67 
 
 
153 aa  117  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  37.58 
 
 
168 aa  117  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  40.37 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  36.97 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  40.38 
 
 
156 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  47.41 
 
 
160 aa  114  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  40.38 
 
 
156 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  39.74 
 
 
156 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  40.38 
 
 
156 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  41.67 
 
 
446 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  39.1 
 
 
156 aa  110  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  39.1 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  39.1 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  39.1 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  43.04 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  39.1 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  39.1 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  39.1 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  46.94 
 
 
149 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  50.51 
 
 
152 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  44.95 
 
 
155 aa  99.4  1e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  46.49 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  43.36 
 
 
168 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  34.93 
 
 
190 aa  97.1  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  39.85 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  46.79 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  38.35 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  38.35 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  38.03 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  38.03 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  46.85 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  44.96 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  39.84 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  40.88 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  44.76 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  45.22 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  39.13 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  36.67 
 
 
195 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  41.94 
 
 
200 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  43.3 
 
 
176 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  40.88 
 
 
160 aa  90.5  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  39.1 
 
 
161 aa  90.1  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  40.15 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  37.23 
 
 
201 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  39.64 
 
 
169 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  45.28 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  38.52 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  42.11 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  44.44 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  49.44 
 
 
114 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  51.11 
 
 
129 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  39.02 
 
 
135 aa  87  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  42.74 
 
 
169 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  43.3 
 
 
195 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  41.94 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  41.96 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  39.02 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  42.19 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  41.73 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  35.43 
 
 
190 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  42.15 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  40.22 
 
 
189 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.09 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  46.85 
 
 
127 aa  85.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  38.21 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  37.98 
 
 
165 aa  84.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1537  putative metalloprotease  38.17 
 
 
145 aa  84.7  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.576398  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  40.5 
 
 
170 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  47.06 
 
 
172 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  41.22 
 
 
185 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  39.66 
 
 
171 aa  84  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  38.46 
 
 
167 aa  84  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  37.21 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  40.74 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  38.67 
 
 
166 aa  83.6  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  36.84 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  46.39 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  43.43 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  43.43 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  43.75 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  43.43 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  42.86 
 
 
411 aa  81.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  40.87 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  37.82 
 
 
175 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>