More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2231 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2231  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
149 aa  298  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207235  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1814  hypothetical protein  63.77 
 
 
140 aa  164  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.28628  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  55 
 
 
155 aa  142  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  38.52 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  40.15 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  44 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  41.73 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  37.12 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  47.06 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  39.17 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  40 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  41.07 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  43.64 
 
 
446 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  43.97 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  44.14 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  37.84 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  48.42 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  40 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.58 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  43.93 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  43.88 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  36.36 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  42 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  42.2 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  39.2 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  46.46 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  39.2 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  41.58 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  41.84 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  38.94 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  38.94 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  45.65 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  44 
 
 
301 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  40.82 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  40.82 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  40.82 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  40.82 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  40.82 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  40.82 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  40.82 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  40.82 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  39.42 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  43.43 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0743  putative metalloprotease  40 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  40.43 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  39.8 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  39.22 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  42.22 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  42.55 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  43.48 
 
 
411 aa  70.5  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  43.18 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  43.18 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  43.18 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  41.75 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  37.5 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  40.62 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  41.38 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  42.86 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  42.22 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  40.62 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  34.95 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  44.71 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  33.08 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  44.68 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  36.19 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  41.58 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  33.08 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  39.18 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  36.22 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  33.81 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  33.03 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  38.1 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  32.33 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  32.85 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  39.36 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.28 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  45.83 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  37.04 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  39.13 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  43.18 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  38.61 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  46.74 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  35.79 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  32.09 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  39.78 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  39.42 
 
 
176 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  32.81 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  37.04 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  40.45 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  34.23 
 
 
201 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  38 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  40.22 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  31.58 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  33.65 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  39.45 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>