More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0671 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  63.2 
 
 
135 aa  158  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  62.5 
 
 
135 aa  156  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  63.2 
 
 
134 aa  156  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  55.88 
 
 
134 aa  152  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0743  putative metalloprotease  62.28 
 
 
138 aa  147  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1537  putative metalloprotease  58.4 
 
 
145 aa  146  7e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.576398  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  54.26 
 
 
137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  50.72 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0449  putative metalloprotease  55.2 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  43.48 
 
 
159 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  42.15 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  39.73 
 
 
446 aa  89.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  41.23 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  42.24 
 
 
160 aa  84.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  38.84 
 
 
168 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  43.1 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  37.32 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  41.23 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.4 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  44.44 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  37.19 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  36.59 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  40.52 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  34.43 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  32.69 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  33.54 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  33.77 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  40.45 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  38.14 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  36 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  36 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  41.57 
 
 
411 aa  75.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  38.33 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  38.05 
 
 
301 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  38.33 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  42.34 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  34.19 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  47.19 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  37.93 
 
 
162 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  39.62 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  36.84 
 
 
190 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  31.13 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  31.13 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  34.31 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1971  hypothetical protein  31.34 
 
 
185 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603125  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  36.55 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  41.05 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  41.84 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  31.13 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  31.13 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  31.13 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  31.13 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  31.13 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  31.13 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  31.13 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  36.67 
 
 
177 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  36.67 
 
 
177 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  36.67 
 
 
177 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  42 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  30.46 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  40.82 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  43.62 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1814  hypothetical protein  41.76 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.28628  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  44.83 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  37.7 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  44.32 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  37.17 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  38.53 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  35.96 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.11 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  45.45 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  37.17 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  41.05 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  42.7 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  36.36 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  35.4 
 
 
190 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  35.09 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  35.71 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  42.2 
 
 
157 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.95 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  37.29 
 
 
176 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  42.2 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  38.95 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  38.54 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  36.28 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  35.9 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  38.6 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  31.54 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  37.63 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  40.23 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  36.79 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  40.23 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  40.23 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  39.33 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  40.23 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>