More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2205 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  79.74 
 
 
153 aa  245  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  78 
 
 
153 aa  241  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  80 
 
 
150 aa  228  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  68 
 
 
151 aa  211  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  66.45 
 
 
173 aa  202  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  67.13 
 
 
155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  62.67 
 
 
177 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  62.67 
 
 
177 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  62.67 
 
 
177 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  66.23 
 
 
164 aa  193  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  62.67 
 
 
178 aa  192  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  63.01 
 
 
157 aa  192  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  61.64 
 
 
157 aa  191  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  61.18 
 
 
184 aa  191  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  65.31 
 
 
162 aa  189  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  63.33 
 
 
153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  62.34 
 
 
159 aa  184  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  63.16 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  59.46 
 
 
183 aa  181  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  60.9 
 
 
156 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  63.19 
 
 
167 aa  178  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  58.67 
 
 
186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  60.78 
 
 
160 aa  177  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  60 
 
 
187 aa  175  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  62.84 
 
 
186 aa  174  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  58.39 
 
 
156 aa  173  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  60.67 
 
 
182 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  56.58 
 
 
188 aa  169  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  54.36 
 
 
166 aa  166  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  54.55 
 
 
156 aa  166  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  56.08 
 
 
149 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  61.33 
 
 
179 aa  165  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  57.69 
 
 
157 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  57.05 
 
 
170 aa  163  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  57.89 
 
 
201 aa  160  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  57.24 
 
 
159 aa  156  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  59.86 
 
 
157 aa  140  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  39.83 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  40.83 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  40.83 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  43.8 
 
 
181 aa  90.1  9e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  42.11 
 
 
156 aa  89  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  46.85 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  37.59 
 
 
446 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  41.59 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  31.47 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.3 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  40.52 
 
 
301 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  37.93 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  37.38 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  38.19 
 
 
154 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  31.13 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  36 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  36.43 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  38.21 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  39.52 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  41.82 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  39.83 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  36.13 
 
 
156 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  38.18 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  38.18 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  37.5 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  32.21 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  40.35 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  35.82 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  40.95 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  36.11 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  36.11 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  33.11 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  32.38 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  33.11 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  33.11 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  33.11 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  30.91 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  30.89 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  35.78 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  32.03 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  39.64 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  36.61 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  32.87 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  34.35 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  32.43 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  39.47 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  37.1 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  32.68 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  32.65 
 
 
169 aa  70.1  0.000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  38.6 
 
 
158 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  38.6 
 
 
158 aa  70.1  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  40.2 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  35.34 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0777  hypothetical protein  43.16 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756727  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  38.02 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>