More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1270 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 181 aa  353  5.999999999999999e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  39.87 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  39.24 
 
 		 167 aa  104  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  43.79 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  40.37 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  39.75 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  39.63 
 
 		 156 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  39.51 
 
 		 156 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  44.51 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  36.48 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  39.64 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  43.9 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  40.38 
 
 		 151 aa  98.6  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  39.63 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  35.85 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.01 
 
 		 157 aa  95.9  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  35.85 
 
 		 177 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  35.85 
 
 		 177 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  35.85 
 
 		 177 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  42.58 
 
 		 150 aa  94.4  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  37.11 
 
 		 182 aa  94  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  37.27 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.51 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  36.08 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  40.61 
 
 		 153 aa  91.7  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  37.34 
 
 		 186 aa  90.9  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  38.36 
 
 		 159 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  36.65 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  36.55 
 
 		 142 aa  88.2  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  42.75 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  35 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  36.23 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  35.19 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  42.31 
 
 		 301 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  43.42 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  36.14 
 
 		 157 aa  85.9  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  36.9 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  37.01 
 
 		 156 aa  84.3  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.69 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  32.43 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  36.14 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  39.17 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  36.71 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  36.11 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  34.57 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  36.62 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  36.62 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.48 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  31.48 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  33.54 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  30 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  35.37 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  39.2 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  38.33 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  38.33 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  36.07 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  41.18 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  36.92 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  36.92 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  35.26 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  39.02 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  35.21 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  33.56 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  35.92 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  39.37 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  36.71 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  35.85 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  41.53 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  34.34 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  38.17 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1642  protein of unknown function UPF0054  46.77 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0208313  hitchhiker  0.00194767 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  40.83 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  35.77 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  34.96 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  33.85 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  32.64 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  35.22 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  35.48 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  35.48 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  36.65 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  36.57 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  34.15 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  39.69 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  37.82 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  38.41 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  35.25 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  39.84 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  36.57 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  38.89 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  37.7 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  35.4 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>