More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0184 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  358  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  95.53 
 
 
179 aa  343  8e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02021  metal-dependent hydrolase  94.41 
 
 
179 aa  337  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  65.93 
 
 
135 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  37.65 
 
 
189 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  40.13 
 
 
166 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27401  metal-dependent hydrolase  35.88 
 
 
187 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  40.56 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1550  hypothetical protein  41.61 
 
 
184 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02581  metal-dependent hydrolase  41.61 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.682893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  34.86 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  36.42 
 
 
169 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  34.25 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  33.12 
 
 
183 aa  89  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  37.5 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.35 
 
 
142 aa  88.2  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  34.13 
 
 
174 aa  87.8  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  37.59 
 
 
162 aa  85.9  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  39.17 
 
 
159 aa  85.9  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  36.52 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  36.61 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  32.89 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  32.76 
 
 
301 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  36.89 
 
 
158 aa  82  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  36.97 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  42.48 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  35.48 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  38.26 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  37.61 
 
 
156 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  40.74 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  32.06 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  34.88 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  34.88 
 
 
168 aa  79  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  35.71 
 
 
153 aa  79  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  37.76 
 
 
446 aa  78.6  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2326  protein of unknown function UPF0054  38.33 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.475999 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  37.96 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  37.96 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2275  protein of unknown function UPF0054  38.33 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  36.89 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  35.29 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  36.84 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  36.61 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  37.27 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  37.61 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  37.61 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  37.61 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  37.61 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  37.61 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  37.61 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  37.61 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  38.18 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  34.91 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  42.05 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  32.74 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  33.58 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  33.33 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  33.64 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  32.38 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  29.55 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  36.7 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  29.55 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  32.74 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  34.23 
 
 
153 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  32.79 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  32.79 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  33.33 
 
 
162 aa  72  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  32.79 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  35.29 
 
 
153 aa  72  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  26.03 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  31.82 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  31.01 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  34 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  36.36 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  35 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  37.86 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  31.73 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  33.98 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.29 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  33.98 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  37.61 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  32.14 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  31.58 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  32.41 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  31.36 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  37.27 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  31.53 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  30.63 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  30.77 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  33.33 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  32.28 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  37.37 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  31.82 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  33.61 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  35.78 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  38.14 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  33.33 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>