More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1071 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  100 
 
 
139 aa  279  7.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  50.72 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1537  putative metalloprotease  58.87 
 
 
145 aa  144  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.576398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0449  putative metalloprotease  54.47 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  53.28 
 
 
134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  54.84 
 
 
135 aa  130  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  54.76 
 
 
134 aa  130  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  54.84 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0743  putative metalloprotease  48.44 
 
 
138 aa  124  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  48.03 
 
 
137 aa  124  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3537  hypothetical protein  44.55 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  36.8 
 
 
160 aa  84.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  39.67 
 
 
158 aa  84  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  42.34 
 
 
154 aa  84  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  39.02 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.1 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  35.34 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  38.94 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  41.74 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  36.36 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  35.46 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  41.58 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  41.58 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  43.18 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  36.44 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  43.16 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  36.97 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  43.16 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  43.16 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  40.38 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  33.08 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  43.16 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  38.05 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  42.11 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  34.88 
 
 
158 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  34.09 
 
 
156 aa  77  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  33.33 
 
 
411 aa  77  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  37.84 
 
 
157 aa  76.6  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  40.35 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  35.29 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  35.29 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  42.2 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  36.13 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  42.11 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  34.65 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 
446 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  36.13 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  46.34 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  33.77 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  37.38 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  45.05 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  37.14 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4066  hypothetical protein  31.5 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  36.61 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  38.53 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  31.95 
 
 
168 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  37.31 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  33.33 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  35 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  35 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  35 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  35 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  45.98 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  35 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  35 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  35.85 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  40.4 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  38.74 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  32.9 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  34.17 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  40.54 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  33.33 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  35.16 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  34.43 
 
 
161 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  32.81 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  36.52 
 
 
162 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  43.96 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  35 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  43.96 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  43.96 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  38.61 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  41.41 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  43.96 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  41.41 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  41.41 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  37 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  34.92 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  33.59 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  41.41 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  41.41 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  33.59 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  34.58 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  33.08 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  36.44 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  36.07 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  33.58 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  44.19 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  33.58 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>