More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0988 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0988  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  297  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  48.82 
 
 
150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  48.44 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0577  hypothetical protein  39.84 
 
 
138 aa  105  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.585949  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  35.25 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  40 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  34.11 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.63 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  31.15 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  32.87 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  28.17 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  34.45 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  39.77 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  28.93 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  35.21 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  33.09 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  32.81 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  29.93 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  31.21 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1071  putative metalloprotease  35.05 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.729568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  35.09 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  33.58 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  30.97 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  32.77 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  33.61 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  31.9 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  35.4 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  32.35 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  30.97 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  30.97 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  30.97 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  30.97 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  30.97 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  30.97 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  33.03 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  37.78 
 
 
274 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  40.21 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  30.83 
 
 
301 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  34.29 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  31.16 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  31.78 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  32.99 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  31.06 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  31.9 
 
 
157 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  33.98 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  30.25 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  30.6 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  33.33 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  29.92 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  33.33 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  33.93 
 
 
255 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0223  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.67 
 
 
270 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1067  protein of unknown function UPF0054  28.99 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0887  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.67 
 
 
270 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2435  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.67 
 
 
270 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0589  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  39.51 
 
 
437 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0721  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.67 
 
 
270 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0706  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.67 
 
 
273 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  29.51 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.67 
 
 
270 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2355  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  36.67 
 
 
270 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  27.54 
 
 
174 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  32.04 
 
 
446 aa  61.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  35.4 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  31.09 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  32.41 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0156  putative metalloprotease  32.41 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.330077  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  30.08 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  28.7 
 
 
182 aa  60.5  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  31.97 
 
 
161 aa  60.1  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  33.63 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  32.69 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  31.71 
 
 
270 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  27.93 
 
 
201 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0410  hypothetical protein  34.31 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.135617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  32.54 
 
 
245 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  33.04 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  30.28 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  34.95 
 
 
270 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  30.56 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  30.28 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  32.08 
 
 
181 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  32.28 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  32.79 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  32.17 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4242  hypothetical protein  32.32 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.912451  normal  0.436066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0508  hypothetical protein  32.32 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  35.71 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  30.56 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  29.73 
 
 
193 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  32.11 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0491  protein of unknown function UPF0054  31.31 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.459013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3702  hypothetical protein  31.31 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.918527  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  30.7 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  31.45 
 
 
258 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  28.93 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>