211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0263 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
165 aa  334  3.9999999999999995e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  32.43 
 
 
301 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  33.6 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1550  hypothetical protein  34.58 
 
 
184 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  34.51 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  31.62 
 
 
155 aa  62.4  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  33.04 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  37.89 
 
 
143 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  29.31 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  33.33 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02581  metal-dependent hydrolase  33.98 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.682893  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  30.25 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  29.31 
 
 
201 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  32 
 
 
156 aa  61.2  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.69 
 
 
142 aa  61.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  34 
 
 
142 aa  61.2  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  32.52 
 
 
183 aa  60.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  37.25 
 
 
146 aa  60.8  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  28.91 
 
 
184 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02021  metal-dependent hydrolase  27.88 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  35.71 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  31.47 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  31.2 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  29.17 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  29.59 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  28.57 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  34.41 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  30.48 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  30.97 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  30.09 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  34.92 
 
 
131 aa  58.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2519  hypothetical protein  36.54 
 
 
177 aa  58.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  30.58 
 
 
152 aa  58.2  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  28.21 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  30.63 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  30.65 
 
 
187 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  30 
 
 
150 aa  57.4  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  28.81 
 
 
156 aa  57.4  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  33.02 
 
 
137 aa  57.4  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  26.42 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  34 
 
 
127 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  25.83 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  42.86 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1403  hypothetical protein  32 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  30 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  28.57 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  28.57 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  29.75 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  28.17 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  26.92 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  28.57 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0061  putative metalloprotease  30.4 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  30.58 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  26.09 
 
 
188 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  31.11 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  40 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  33.96 
 
 
411 aa  55.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  28.7 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  39.74 
 
 
141 aa  55.5  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  28.21 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  34.52 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  31.97 
 
 
182 aa  54.3  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  23.36 
 
 
135 aa  54.3  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  54.3  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  29.06 
 
 
173 aa  54.3  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  29.46 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  41.54 
 
 
165 aa  54.3  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  29.73 
 
 
157 aa  54.3  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0705  hypothetical protein  35.58 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.276806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  28.21 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  31.09 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  29.73 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  29.84 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  30.53 
 
 
140 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  27.12 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1242  putative metalloprotease  28.07 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33223  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  29.84 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  30.89 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  26.79 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  31.53 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1283  hypothetical protein  31.91 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032786  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  28.57 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  29.82 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  29.91 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1155  hypothetical protein  30.1 
 
 
154 aa  51.2  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.8201  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  30.43 
 
 
150 aa  51.2  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  35.35 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  28.7 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  29.93 
 
 
180 aa  50.8  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  24.67 
 
 
161 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  28.95 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  27.5 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  28.7 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27401  metal-dependent hydrolase  29.57 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  28.07 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  29.9 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  28.07 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  26.67 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>