61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2519 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2519  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  357  6e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_002620  TC0705  hypothetical protein  32.56 
 
 
161 aa  60.8  0.000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.276806  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0263  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104148  normal  0.500698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  25.87 
 
 
146 aa  55.1  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  31.67 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  24.37 
 
 
138 aa  52.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0510  hypothetical protein  29.17 
 
 
151 aa  51.6  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  27.94 
 
 
156 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  27.59 
 
 
140 aa  51.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  31.78 
 
 
162 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  31.4 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2127  protein of unknown function UPF0054  26.85 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000283027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  28.12 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  25 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  30.07 
 
 
173 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  33.64 
 
 
178 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  28.15 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  26.09 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  32.8 
 
 
168 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  29.91 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  30.26 
 
 
146 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  25.34 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  28.44 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  25.38 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  26.72 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  29.06 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  34.55 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  27.27 
 
 
142 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  34.55 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  32.73 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  30.25 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  34.55 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  30.97 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  28 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  31.4 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  32.17 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  45.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  30.77 
 
 
157 aa  45.1  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  28.21 
 
 
151 aa  44.3  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  27.81 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  29.2 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  28.33 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  28.7 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  34.26 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  29.51 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  29.01 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  27.73 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  28.57 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  30.91 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  30.83 
 
 
154 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  29.2 
 
 
188 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  27.84 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  31.2 
 
 
127 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  29.73 
 
 
138 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  22.37 
 
 
142 aa  42  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  32.99 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  31.82 
 
 
182 aa  41.2  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  26.98 
 
 
446 aa  41.2  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  27.83 
 
 
171 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  29.27 
 
 
156 aa  40.8  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>