More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2234 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 		 163 aa  336  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  35.29 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  37.23 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  34.11 
 
 		 446 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  34.01 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  34.29 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  35.29 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  39.67 
 
 		 301 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1730  protein of unknown function UPF0054  36.72 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.90197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  29.3 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  33.58 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  37.3 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  33.09 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  36.61 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  35.88 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0065  hypothetical protein  35.19 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129907 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  29.37 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  32.12 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  29.75 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  37.61 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  35.54 
 
 		 128 aa  72  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  35 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  35.29 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1173  hypothetical protein  28.38 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  32.85 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  31.85 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  29.24 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  31.17 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  31.85 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  33.33 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  34.17 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0237  protein of unknown function UPF0054  34.56 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.524692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  33.55 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  34.17 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  34.17 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  34.17 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  34.17 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  34.17 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  34.17 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  35.29 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  34.71 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  33.11 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1736  hypothetical protein  32.8 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  35.54 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  30.61 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  30.61 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  35.25 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  28.12 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  34.65 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  33.11 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  32.03 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  30.56 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  30.83 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1583  protein of unknown function UPF0054  32.26 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  34.38 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  31.45 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  29.94 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1233  hypothetical protein  35.17 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0971  protein of unknown function UPF0054  28.06 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.529698 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  33.91 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5558  protein of unknown function UPF0054  30.77 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  25.81 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  31.47 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1505  protein of unknown function UPF0054  27.21 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000651166  normal  0.957215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  29.38 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  30.07 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  30.77 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1004  hypothetical protein  29.77 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.84934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3801  protein of unknown function UPF0054  27.94 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1354  hypothetical protein  32.28 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  28.57 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  31.67 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03360  hypothetical protein  29.55 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.755066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  31.67 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  28.86 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0746  protein of unknown function UPF0054  26.39 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  30.89 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  28.39 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  28.76 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  30.99 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  27.89 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  34.34 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3501  hypothetical protein  25.78 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0394911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  27.88 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  27.88 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  29.27 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0282  hypothetical protein  27.74 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.135997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0007  protein of unknown function UPF0054  25.9 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  32.26 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  30.33 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  30.33 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  30.33 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  30.33 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  32.76 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  28.28 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  30.33 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  28.46 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  33.62 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  27.81 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>