More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1233 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  303  6e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  57.14 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  62.5 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0998  protein of unknown function UPF0054  63.36 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.422032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3262  protein of unknown function UPF0054  63.71 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  62.5 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2284  hypothetical protein  63.21 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.621192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  54.62 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  46.55 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0777  hypothetical protein  54.35 
 
 		 97 aa  100  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.756727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  52.34 
 
 		 193 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  42.76 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  46.96 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  46.09 
 
 		 161 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  47.22 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  47.22 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  47.22 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  39.22 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  42.28 
 
 		 154 aa  93.6  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  50.43 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  50.43 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  37.68 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  45.39 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  46.67 
 
 		 172 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  33.57 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  46.21 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  50.89 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  41.41 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  49.07 
 
 		 174 aa  88.6  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  47.69 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  45.05 
 
 		 168 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  47.79 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  43.69 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  48.18 
 
 		 301 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  45.69 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  44.44 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  43.59 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  35.97 
 
 		 195 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  38.05 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  39.49 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  44.63 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  41.18 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  40.85 
 
 		 157 aa  84.3  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  42.34 
 
 		 168 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  48.84 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  40.5 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  40.83 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1416  protein of unknown function UPF0054  38.52 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  38.46 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  42.42 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  36.59 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  43.81 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  40.71 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  40.32 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  43.24 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2165  hypothetical protein  41.74 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  38.52 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  35.76 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  46.67 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  40.19 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2234  protein of unknown function UPF0054  35.66 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.797787  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  34.9 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  42.59 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  39.32 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  41.78 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  39.16 
 
 		 171 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  36.64 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  43.82 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  39.68 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  38.71 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  37.82 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  41.9 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  46.07 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  45.45 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  38.53 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  38.24 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  39.81 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  42.45 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  41.82 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  39.45 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  45.45 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  37.5 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  45.45 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  43.62 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  42.71 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  44.32 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4096  hypothetical protein  39.34 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  38.32 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  35.37 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.68 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>