190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1979 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1979  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 135 aa  274  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.261351  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0148  TPR repeat-containing protein  67.67 
 
 		 150 aa  189  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00197515  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1670  TPR repeat-containing protein  58.78 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0511  TPR repeat-containing protein  59.7 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.476572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1491  TPR repeat-containing protein  55.3 
 
 		 134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137744  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0505  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.84 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.6696 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1126  TPR repeat-containing protein  48.51 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000467816  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.06 
 
 		 308 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  33.58 
 
 		 706 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 308 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  32.84 
 
 		 706 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  34.85 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.33 
 
 		 582 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  34.11 
 
 		 581 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.06 
 
 		 462 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 404 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 1421 aa  73.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 331 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  34.09 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  38.21 
 
 		 178 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.28 
 
 		 406 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.28 
 
 		 406 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 361 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  31.06 
 
 		 539 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 280 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.28 
 
 		 343 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.52 
 
 		 541 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 205 aa  63.5  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.81 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.23 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 428 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 617 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4022  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 333 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.51 
 
 		 357 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 547 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  32.8 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.81 
 
 		 373 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.27 
 
 		 528 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.05 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  34.91 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 297 aa  57.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 391 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 290 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.89 
 
 		 474 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.66 
 
 		 778 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 605 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 243 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.25 
 
 		 471 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 446 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  27.34 
 
 		 1240 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 352 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 425 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  30.08 
 
 		 518 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 		 542 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 248 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 292 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 515 aa  53.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 738 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 349 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.23 
 
 		 746 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.5 
 
 		 839 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.13 
 
 		 988 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 615 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 295 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 292 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 		 342 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0110  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.2 
 
 		 818 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 		 1022 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 543 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 392 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 422 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 707 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 649 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  26.27 
 
 		 442 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 266 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.965308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.63 
 
 		 1056 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.03 
 
 		 248 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  31.19 
 
 		 415 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0131  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 804 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2890  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 599 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0313082 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  29.07 
 
 		 750 aa  47.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>