217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0505 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0505  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 139 aa  276  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.6696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1491  TPR repeat-containing protein  60.48 
 
 		 134 aa  147  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137744  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0148  TPR repeat-containing protein  54.03 
 
 		 150 aa  136  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00197515  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1979  TPR repeat-containing protein  54.84 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.261351  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1670  TPR repeat-containing protein  50.79 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0511  TPR repeat-containing protein  50.81 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.476572  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1126  TPR repeat-containing protein  47.01 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000467816  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  36.64 
 
 		 706 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 		 404 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  37.21 
 
 		 306 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  36 
 
 		 706 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  37.6 
 
 		 334 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  36.51 
 
 		 462 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.6 
 
 		 406 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.6 
 
 		 406 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.11 
 
 		 308 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  37.98 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.38 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  34.11 
 
 		 582 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  34.4 
 
 		 581 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  32.58 
 
 		 539 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1421 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 		 280 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 		 361 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 605 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0163  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 306 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 547 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 428 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 371 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 446 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.7 
 
 		 542 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 471 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0119  hypothetical protein  35.65 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000942476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  32.79 
 
 		 1240 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.23 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  33.62 
 
 		 695 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.93 
 
 		 189 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 391 aa  60.1  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 738 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1707  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 515 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18061  hypothetical protein  32.14 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.51 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  29.82 
 
 		 442 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.61 
 
 		 343 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  26.77 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 617 aa  57  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  31.58 
 
 		 269 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  48.28 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18241  hypothetical protein  30 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.219981  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00551  hypothetical protein  33.03 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.276796  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01941  Tfp pilus assembly protein PilF  32.26 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  36.78 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.39 
 
 		 357 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 422 aa  53.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.6 
 
 		 458 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.41 
 
 		 237 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 707 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 543 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 699 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.9 
 
 		 289 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 649 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.65 
 
 		 746 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 425 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 376 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00531  hypothetical protein  30.56 
 
 		 250 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 687 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 304 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0731  hypothetical protein  44.12 
 
 		 567 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 425 aa  50.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 628 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 352 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 269 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 248 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1191  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 262 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 556 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 289 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 284 aa  50.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  32.29 
 
 		 1138 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3682  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 288 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>