200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0511 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0511  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
134 aa  270  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.476572  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0148  TPR repeat-containing protein  59.85 
 
 
150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00197515  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1979  TPR repeat-containing protein  59.7 
 
 
135 aa  158  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.261351  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1491  TPR repeat-containing protein  53.12 
 
 
134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137744  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1670  TPR repeat-containing protein  54.2 
 
 
138 aa  140  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.177973  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0505  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.81 
 
 
139 aa  123  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.6696 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1126  TPR repeat-containing protein  44.03 
 
 
134 aa  103  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000467816  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.88 
 
 
406 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.88 
 
 
406 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  36.64 
 
 
706 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  31.06 
 
 
706 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.81 
 
 
308 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  34.62 
 
 
539 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  33.33 
 
 
306 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
605 aa  68.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
306 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
391 aa  67.4  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  35.61 
 
 
581 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
331 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.56 
 
 
582 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  31.82 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
286 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
361 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
286 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.31 
 
 
462 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
357 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
280 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 
547 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.16 
 
 
746 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 
284 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.61 
 
 
219 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 
308 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
286 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.92 
 
 
542 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
271 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 
425 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.52 
 
 
373 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
248 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
515 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
1421 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 
290 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.65 
 
 
471 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
306 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
428 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
422 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.8 
 
 
778 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.84 
 
 
343 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 
349 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2626  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.56 
 
 
839 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
292 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
297 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
617 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
404 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
649 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
352 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
292 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.83 
 
 
248 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.28 
 
 
1022 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
202 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
1827 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
269 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.61 
 
 
836 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
707 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 
1056 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
269 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
291 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.8 
 
 
818 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  29.31 
 
 
442 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  31.53 
 
 
270 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
927 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
446 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.79 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0163  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
256 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
266 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  33.62 
 
 
672 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0009  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
267 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  42.31 
 
 
715 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.98 
 
 
738 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
699 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
318 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
270 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.11 
 
 
560 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  25.98 
 
 
1240 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
392 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  33.71 
 
 
661 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0055  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.69 
 
 
1056 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
270 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
628 aa  48.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
1276 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
273 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
543 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>