180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_891 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_891  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  252  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.965308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  48.61 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.96 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.38 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  37.38 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  44.93 
 
 		 582 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 269 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.16 
 
 		 1056 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  41.43 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35 
 
 		 784 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  38.37 
 
 		 273 aa  54.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.19 
 
 		 542 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 306 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  37.84 
 
 		 452 aa  53.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 392 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.71 
 
 		 818 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  30.33 
 
 		 1056 aa  52  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  40.28 
 
 		 539 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 		 357 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 		 422 aa  50.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  42.03 
 
 		 462 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  44.93 
 
 		 706 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 266 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 187 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 404 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.72 
 
 		 839 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  34.62 
 
 		 1007 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  39.24 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 		 308 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  38.57 
 
 		 334 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.78 
 
 		 367 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1979  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.261351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.29 
 
 		 1022 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.21 
 
 		 1056 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 		 361 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  36.11 
 
 		 1240 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.27 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 731 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2987  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 266 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 988 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 305 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.25 
 
 		 746 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 331 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.44 
 
 		 471 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 270 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 319 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 270 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 1421 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.94 
 
 		 263 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1191  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 262 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 269 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  36.78 
 
 		 581 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0055  TPR repeat-containing protein  45.16 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.24 
 
 		 308 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 499 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  41.79 
 
 		 750 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.39 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3390  TPR repeat-containing protein  42.19 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  34.25 
 
 		 407 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.19 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 421 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  36.76 
 
 		 385 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 617 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 927 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2199  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 555 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00873535  hitchhiker  0.0000489477 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 1827 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 		 515 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  31.82 
 
 		 929 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  41.43 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  40.58 
 
 		 706 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 523 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 687 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 1276 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  34.78 
 
 		 820 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 371 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 279 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 591 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 255 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.88 
 
 		 541 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20661  hypothetical protein  33.73 
 
 		 262 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10519  predicted protein  33.87 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0851  hypothetical protein  35.38 
 
 		 544 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 750 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 649 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  34.85 
 
 		 309 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.86 
 
 		 738 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 361 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 605 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 239 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.33 
 
 		 406 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.33 
 
 		 406 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  41.43 
 
 		 306 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 504 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  28.24 
 
 		 270 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1631  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 299 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.863569  normal  0.0840181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 635 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 635 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>