More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1631 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1631  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 299 aa  601  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.863569  normal  0.0840181 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0815  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 310 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0844  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 310 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  31.55 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  32.33 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 406 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 406 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 371 aa  96.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  33.16 
 
 		 334 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.94 
 
 		 462 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.16 
 
 		 1056 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.18 
 
 		 1022 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 649 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 271 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.42 
 
 		 818 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.43 
 
 		 738 aa  89  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.67 
 
 		 1056 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.94 
 
 		 820 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.71 
 
 		 988 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.65 
 
 		 784 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  29.05 
 
 		 581 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 547 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 391 aa  86.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 804 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  39.52 
 
 		 270 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  32.14 
 
 		 706 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  28.98 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  37.9 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 543 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.06 
 
 		 746 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.12 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.64 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.21 
 
 		 542 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 392 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 716 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  31.71 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.24 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 446 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.6 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  30.54 
 
 		 706 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1421 aa  79.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.29 
 
 		 1694 aa  79  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 255 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 593 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  29.19 
 
 		 539 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 699 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 617 aa  77.4  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  26.15 
 
 		 1240 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 836 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 		 422 aa  75.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.54 
 
 		 373 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 605 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.5 
 
 		 1007 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 1276 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  27.92 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  31.19 
 
 		 750 aa  73.6  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.53 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  26.54 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.82 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 927 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 428 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39 
 
 		 474 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 687 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 1192 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 1276 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 750 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38 
 
 		 541 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>