131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1126 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1126  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
134 aa  266  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000467816  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1979  TPR repeat-containing protein  48.51 
 
 
135 aa  123  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.261351  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0505  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.01 
 
 
139 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.6696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1491  TPR repeat-containing protein  47.29 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137744  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1670  TPR repeat-containing protein  44.7 
 
 
138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.177973  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0148  TPR repeat-containing protein  45.97 
 
 
150 aa  110  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00197515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0511  TPR repeat-containing protein  44.03 
 
 
134 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.476572  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  34.13 
 
 
582 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.35 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  33.61 
 
 
706 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.16 
 
 
406 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.16 
 
 
406 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  36.96 
 
 
1240 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 
308 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
331 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  33.83 
 
 
581 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
404 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  37.36 
 
 
233 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.8 
 
 
462 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  31.06 
 
 
306 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  34.38 
 
 
706 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.96 
 
 
746 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
202 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  35.48 
 
 
539 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  35.71 
 
 
612 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
605 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 
547 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
361 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
306 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
371 aa  52.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
260 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 
261 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
425 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
271 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.4 
 
 
219 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  45.59 
 
 
523 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
1421 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 
373 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
4079 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
280 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
927 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2199  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
555 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00873535  hitchhiker  0.0000489477 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 
391 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  29.36 
 
 
417 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
280 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.75 
 
 
343 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
349 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4022  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
333 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0055  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
166 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  32.26 
 
 
442 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
297 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  46.67 
 
 
672 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 
988 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
352 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.04 
 
 
836 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.16 
 
 
357 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 
695 aa  46.2  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
248 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
446 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  36.49 
 
 
309 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
239 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
392 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
266 aa  45.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
422 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 
471 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
617 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
292 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.27 
 
 
839 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.12 
 
 
778 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1191  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 
262 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
428 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
543 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20661  hypothetical protein  35.9 
 
 
262 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
178 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 
1056 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
390 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
279 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7350  hypothetical protein  39.24 
 
 
668 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
269 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  32.18 
 
 
1007 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
1049 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
515 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
649 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.4 
 
 
1022 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  29.46 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
543 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 
589 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 
955 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1102  hypothetical protein  30.85 
 
 
310 aa  42.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.52 
 
 
235 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
250 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2558  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  30.84 
 
 
750 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.55 
 
 
784 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
818 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.17 
 
 
738 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18061  hypothetical protein  30.19 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
523 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>