More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1620 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1620  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 
927 aa  1893    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  45.58 
 
 
1328 aa  443  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
673 aa  350  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  34.08 
 
 
1005 aa  318  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 
743 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  31.15 
 
 
812 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
632 aa  301  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
1053 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 
657 aa  276  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
962 aa  270  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 
668 aa  269  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
557 aa  268  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
655 aa  267  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
1050 aa  265  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
781 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
1105 aa  264  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  33.33 
 
 
507 aa  263  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 
1106 aa  261  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
810 aa  261  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
650 aa  261  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
769 aa  261  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 
807 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 
1076 aa  260  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
508 aa  260  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 
653 aa  260  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  32.29 
 
 
541 aa  259  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
822 aa  258  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
789 aa  257  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
789 aa  257  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
637 aa  255  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
1095 aa  255  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 
660 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
1260 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  33.08 
 
 
695 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 
1079 aa  252  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
641 aa  252  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
955 aa  251  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 
955 aa  251  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 
782 aa  250  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 
630 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
1260 aa  250  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 
796 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 
651 aa  249  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
796 aa  249  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.89 
 
 
789 aa  248  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 
983 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  27.91 
 
 
678 aa  248  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 
936 aa  247  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  33.33 
 
 
544 aa  247  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  32.11 
 
 
541 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0226  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 
1018 aa  246  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  32.11 
 
 
541 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  32.8 
 
 
539 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  36.02 
 
 
573 aa  245  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 
1176 aa  245  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 
979 aa  244  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
1134 aa  244  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
677 aa  244  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1132 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.93 
 
 
1092 aa  243  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 
734 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  30.43 
 
 
534 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 
640 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  31.39 
 
 
533 aa  241  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
807 aa  241  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
741 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  31.19 
 
 
533 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  26.18 
 
 
1086 aa  240  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 
845 aa  240  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  33.5 
 
 
726 aa  240  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.65 
 
 
845 aa  240  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.3 
 
 
859 aa  240  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  31.67 
 
 
695 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
548 aa  240  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
695 aa  238  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
922 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
673 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
766 aa  239  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 
641 aa  238  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
662 aa  238  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  28.78 
 
 
699 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
999 aa  237  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  31.23 
 
 
544 aa  237  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
773 aa  237  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 
827 aa  237  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  36.72 
 
 
949 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  29.34 
 
 
749 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  25.76 
 
 
844 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
642 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
1050 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
889 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  34.47 
 
 
646 aa  235  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
1193 aa  235  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
762 aa  235  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.55 
 
 
1086 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
926 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.56 
 
 
853 aa  234  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
991 aa  234  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 
849 aa  234  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
752 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>