More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01260 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE01260  cytoplasm protein, putative  100 
 
 
339 aa  700    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04425  3'-> 5' exonuclease 1 endonuclease (Eurofung)  43.65 
 
 
311 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0297669  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5749  predicted protein  40 
 
 
286 aa  199  7e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04964  conserved hypothetical protein  37.07 
 
 
334 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64467  predicted protein  32.35 
 
 
414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  30.89 
 
 
265 aa  126  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  32.69 
 
 
260 aa  125  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  28.8 
 
 
264 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  28.8 
 
 
267 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  31.43 
 
 
270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  29.41 
 
 
256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  27.51 
 
 
267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  29.76 
 
 
256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  27.51 
 
 
267 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  27.18 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  27.51 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  29.35 
 
 
265 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  26.54 
 
 
267 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  26.54 
 
 
267 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  26.54 
 
 
267 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  27.51 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  28.94 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  31.8 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  31.12 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  26.21 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  30 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  30.1 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  33.61 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  30 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  33.61 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  26.21 
 
 
267 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  33.05 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  27.01 
 
 
267 aa  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  31.95 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  30.28 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  29.63 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  31.36 
 
 
260 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  32.63 
 
 
260 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  32.63 
 
 
260 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  32.63 
 
 
264 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  31.12 
 
 
278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  33.05 
 
 
270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  31.78 
 
 
260 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  32.63 
 
 
264 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  32.63 
 
 
260 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  27.99 
 
 
256 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  32.63 
 
 
260 aa  109  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2228  TatD-related deoxyribonuclease  32.5 
 
 
273 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.101612 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  32.63 
 
 
260 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  32.92 
 
 
264 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  30.31 
 
 
260 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  34.45 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  34.6 
 
 
268 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  32.78 
 
 
264 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  30.31 
 
 
264 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  30.31 
 
 
260 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  30.31 
 
 
264 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  34.6 
 
 
268 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  30.31 
 
 
264 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  27.46 
 
 
462 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  26.8 
 
 
258 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  32.2 
 
 
260 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  33.05 
 
 
267 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  32.2 
 
 
260 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  27.36 
 
 
253 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  27.59 
 
 
256 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  32.07 
 
 
260 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  26.3 
 
 
464 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  28.87 
 
 
257 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  25.89 
 
 
271 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  31.54 
 
 
253 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  28.32 
 
 
256 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  33.02 
 
 
265 aa  103  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  27.11 
 
 
259 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  31.22 
 
 
266 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  28.01 
 
 
256 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  32.07 
 
 
260 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  33.61 
 
 
271 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0172  TatD-related deoxyribonuclease  30.13 
 
 
271 aa  102  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  28.18 
 
 
255 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  28.18 
 
 
255 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  28.18 
 
 
255 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.18 
 
 
255 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.18 
 
 
255 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  27.83 
 
 
266 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  28.27 
 
 
262 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  28.18 
 
 
255 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.18 
 
 
255 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.18 
 
 
255 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  27.68 
 
 
461 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1753  TatD-related deoxyribonuclease  33.2 
 
 
265 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000148909 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  27.61 
 
 
264 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  29.43 
 
 
259 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  28.47 
 
 
263 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  27.4 
 
 
255 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  26.86 
 
 
269 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  27.49 
 
 
255 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  27.62 
 
 
256 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  28.07 
 
 
264 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  30.14 
 
 
258 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>