More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1722 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1722  methionine import ATP-binding protein MetN  100 
 
 
217 aa  435  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0667  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase  71.76 
 
 
217 aa  312  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0447  ABC transporter, ATP-binding protein  54.25 
 
 
217 aa  232  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1305  ABC transporter-related protein  50.95 
 
 
212 aa  229  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000307697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1564  ABC transporter related  42.45 
 
 
284 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239809  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.88 
 
 
325 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 
252 aa  124  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  31.73 
 
 
299 aa  122  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  33.01 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  38.16 
 
 
622 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  30.14 
 
 
310 aa  118  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2015  heme exporter protein CcmA  34.45 
 
 
289 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  33.01 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  32.24 
 
 
309 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  29.86 
 
 
263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  30.09 
 
 
335 aa  115  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.02 
 
 
301 aa  115  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  30.19 
 
 
298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  32.41 
 
 
350 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  33.33 
 
 
315 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.7 
 
 
323 aa  114  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1806  ABC transporter related  30.05 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179898  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  34.13 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  32.24 
 
 
309 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  32.24 
 
 
309 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  35.16 
 
 
378 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  32.29 
 
 
309 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  37.69 
 
 
287 aa  112  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  36.73 
 
 
503 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  33.49 
 
 
355 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  31.13 
 
 
295 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  31.13 
 
 
252 aa  112  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  34.42 
 
 
306 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5550  ABC transporter related  31.75 
 
 
231 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149026  hitchhiker  0.000395004 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1078  ABC transporter related  29.38 
 
 
286 aa  112  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  33.8 
 
 
338 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  34.43 
 
 
345 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  33.01 
 
 
298 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.84 
 
 
308 aa  111  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  35.62 
 
 
227 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  28.99 
 
 
235 aa  111  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  30.05 
 
 
337 aa  111  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1210  ABC transporter related  32.23 
 
 
305 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.928511  normal  0.0300377 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  32.73 
 
 
767 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  32.73 
 
 
738 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  26.94 
 
 
329 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  34.4 
 
 
311 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  35.45 
 
 
260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  28.77 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.88 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  32.54 
 
 
304 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  28.5 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3071  ABC transporter related protein  30.14 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  31.25 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  31.58 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  32.57 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  32.58 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  34.25 
 
 
378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  27.31 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  28.04 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  32.55 
 
 
338 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  30.09 
 
 
308 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  33.93 
 
 
313 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  30.09 
 
 
308 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  30.09 
 
 
308 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  33.49 
 
 
338 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  32.27 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  33.17 
 
 
286 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 
555 aa  109  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  30.48 
 
 
318 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  32.27 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1273  ABC transporter related  30.66 
 
 
318 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0737  ABC transporter related  32.86 
 
 
238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0135458 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  33.49 
 
 
338 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  26.51 
 
 
316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  30 
 
 
317 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  32.11 
 
 
308 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  30.62 
 
 
308 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  30.09 
 
 
336 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2399  ABC transporter, ATPase subunit  30 
 
 
299 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196934  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  32.87 
 
 
348 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  32.14 
 
 
309 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  31.11 
 
 
319 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2152  ABC transporter related  29.35 
 
 
302 aa  108  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191779  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  32.27 
 
 
308 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  29.63 
 
 
302 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  32.87 
 
 
348 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  32.3 
 
 
282 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  30.62 
 
 
308 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 
308 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  30.05 
 
 
300 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  29.09 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  34.33 
 
 
712 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  30.59 
 
 
322 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.2 
 
 
629 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  33.64 
 
 
496 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  31.63 
 
 
501 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0857  ABC transporter related  35.07 
 
 
251 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  28.99 
 
 
725 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>