More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1210 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1210  ABC transporter related  100 
 
 		 305 aa  614  1e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.928511  normal  0.0300377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2152  ABC transporter related  50.66 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0219  ABC transporter related  47.81 
 
 		 317 aa  262  6e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.106594 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1078  ABC transporter related  47.95 
 
 		 286 aa  258  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1970  ABC transporter related  48.63 
 
 		 288 aa  244  9e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00267126  hitchhiker  0.00000000346858 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0350  ABC transporter related  43.55 
 
 		 273 aa  224  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0909  ABC transporter related protein  45.64 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000694874  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1780  ABC transporter related  40.14 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.298281 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0174  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00840691  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1475  ABC transporter related  44.31 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.126993  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  36.54 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  35.59 
 
 		 326 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 319 aa  168  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  35.42 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.26 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0573  ABC transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  35.45 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  36.5 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  32.68 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1017  ABC transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  35.62 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  33.9 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.78 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  40.17 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  33.98 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  36.39 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  33.9 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  35.33 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  33.9 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  33.77 
 
 		 319 aa  162  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1156  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.165511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  33.01 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  33.9 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 319 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  32.89 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  34.08 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  33.22 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  34.42 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  34.42 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  34.24 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  34.24 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  40.38 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  34.42 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.67 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  35.37 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  34.25 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  34.8 
 
 		 308 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  34.42 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  38.39 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  37.62 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  35.03 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  38.46 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  36.21 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0431  ABC transporter related  41 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.739427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.66 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.7 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2827  ABC transporter related  35.17 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.66 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  34.25 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  34.68 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  32.55 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0537  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.98 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.0000144488 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  41.78 
 
 		 333 aa  158  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  31.68 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 		 320 aa  158  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  37.92 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  35.62 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  40.85 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.85 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  34.21 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  35.74 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  35.74 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  37.18 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  35.23 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4080  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.65 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  38.05 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  35.74 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  41.78 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  38.5 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.12 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  35.1 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  38.5 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>