More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0350 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0350  ABC transporter related  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0909  ABC transporter related protein  67.66 
 
 
275 aa  384  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000694874  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1210  ABC transporter related  43.55 
 
 
305 aa  224  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.928511  normal  0.0300377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2152  ABC transporter related  44.06 
 
 
302 aa  218  7e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191779  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1078  ABC transporter related  40.36 
 
 
286 aa  201  9e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0219  ABC transporter related  42.91 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.106594 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1780  ABC transporter related  41.46 
 
 
295 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.298281 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1970  ABC transporter related  41.99 
 
 
288 aa  185  8e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00267126  hitchhiker  0.00000000346858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  43.38 
 
 
253 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1124  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.92 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0174  ABC transporter related protein  37.89 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00840691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.69 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 
330 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
316 aa  148  9e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.27 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.47 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.36 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.37 
 
 
338 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  37.1 
 
 
309 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.59 
 
 
345 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.5 
 
 
319 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4937  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.81 
 
 
347 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691547  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.27 
 
 
320 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.28 
 
 
321 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  38.05 
 
 
241 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.37 
 
 
345 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3105  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.09 
 
 
310 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  33.78 
 
 
319 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3165  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 
310 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337194  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 
343 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0431  ABC transporter related  36.63 
 
 
278 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.739427  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.36 
 
 
316 aa  143  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 
241 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.27 
 
 
313 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
253 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.02 
 
 
313 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.44 
 
 
411 aa  142  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.21 
 
 
321 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3454  ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 
253 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 
253 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3213  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  39.73 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3150  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  39.73 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.962721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.61 
 
 
449 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3493  ABC transporter ATP-binding protein  39.27 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.644181  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.64 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0960  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00252533  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1472  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.12 
 
 
371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.269585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.27 
 
 
446 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.43 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3447  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
253 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0135545  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1559  ABC transporter related  35.4 
 
 
284 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6786  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 
322 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00659712  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.16 
 
 
279 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.53 
 
 
312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.1 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.84 
 
 
317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.25 
 
 
359 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.32 
 
 
332 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1560  ABC transporter related  38.22 
 
 
344 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0503147  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23580  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.41 
 
 
324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185553  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  38.36 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0665  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.34 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1684  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.77 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000329487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 
348 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1235  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.84 
 
 
368 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.84 
 
 
323 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.39 
 
 
317 aa  138  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
308 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  38.12 
 
 
307 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1033  ABC transporter related  39.21 
 
 
271 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.107765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 
308 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  35.87 
 
 
305 aa  137  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.348691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 
353 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.9 
 
 
309 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.95 
 
 
308 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0573  ABC transporter ATP-binding protein  34.5 
 
 
307 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5653  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.39 
 
 
255 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  38.81 
 
 
253 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3548  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.39 
 
 
335 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2042  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.27 
 
 
328 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025568  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.78 
 
 
332 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8858  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  34.53 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.12 
 
 
360 aa  136  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.06 
 
 
325 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  31.88 
 
 
318 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0848  ABC-type multidrug transport system, ATP-binding protein  35.87 
 
 
309 aa  136  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.652188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2017  ABC transporter related  37.9 
 
 
273 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 
351 aa  136  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  35.87 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.32 
 
 
308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.55 
 
 
322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.25 
 
 
334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.21 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  36.56 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5258  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.55 
 
 
330 aa  135  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  32.71 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>