More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1806 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1806  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  463  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179898  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4875  ABC transporter related  38.12 
 
 		 279 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3015  ABC transporter related  39.42 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4080  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 		 350 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  37.61 
 
 		 326 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0257  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.28 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0830  ABC transporter related protein  32.28 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2017  ABC transporter related  37.89 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  31.58 
 
 		 319 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  38.12 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1502  ABC transporter related  37.08 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  35.21 
 
 		 335 aa  123  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  32.74 
 
 		 306 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4384  ABC transporter related  36.82 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.548465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  36.11 
 
 		 301 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  36.78 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  31.8 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  34.98 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  34.98 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.16 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  37.33 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  35.71 
 
 		 310 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  35.71 
 
 		 310 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0541  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 308 aa  118  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.62 
 
 		 309 aa  118  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  36.61 
 
 		 304 aa  118  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23580  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 		 324 aa  118  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  34.08 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  32.26 
 
 		 305 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  32.75 
 
 		 310 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  35.24 
 
 		 308 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3953  ABC transporter related  41.04 
 
 		 299 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00887978  normal  0.0604137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 336 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 307 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  35.24 
 
 		 308 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8858  ABC transporter ATP-binding protein  34.67 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  37.21 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  34.19 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  29 
 
 		 320 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  34.08 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  35.24 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1383  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.07 
 
 		 336 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.895851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  29 
 
 		 320 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  31.98 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  35.11 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  32.73 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.39 
 
 		 312 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  33.64 
 
 		 304 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  36.02 
 
 		 297 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  35.14 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  35.14 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  33.05 
 
 		 305 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  31.56 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  34.65 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  33.49 
 
 		 296 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.12 
 
 		 368 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  34.76 
 
 		 308 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  36.56 
 
 		 300 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  35.24 
 
 		 308 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  35.24 
 
 		 308 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  35.91 
 
 		 337 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.39 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.21 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  34.76 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.62 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  35.87 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  33.79 
 
 		 247 aa  114  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  38.38 
 
 		 583 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  30.91 
 
 		 308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1722  methionine import ATP-binding protein MetN  30.05 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  32.08 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  36.56 
 
 		 322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  34.76 
 
 		 308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  36.92 
 
 		 302 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 350 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  28.95 
 
 		 307 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  28.95 
 
 		 307 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0537  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 		 321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.0000144488 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5550  ABC transporter related  27.49 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149026  hitchhiker  0.000395004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  32.88 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  31.25 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  37.28 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  33.64 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>