More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3953 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3953  ABC transporter related  100 
 
 		 299 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00887978  normal  0.0604137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6992  ABC transporter related  54.3 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.34 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  35.76 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086698  normal  0.0445434 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  31.46 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  30.79 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.79 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  30.79 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  30.79 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  30.79 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.79 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  32.67 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  30.46 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  30.46 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.01 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.28 
 
 		 338 aa  165  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  32.67 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  36.44 
 
 		 250 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  36.51 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.3 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  32.15 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24930  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.38 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961926  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  36.72 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  33.94 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.98 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.24 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  41.28 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  31.76 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  36.61 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  39.74 
 
 		 311 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.41 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  41.81 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  37.22 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  32.44 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8157  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.63 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.09 
 
 		 332 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  40.68 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  41.38 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5082  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.96 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  38.44 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  35.43 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  34.33 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.55 
 
 		 348 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  36 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4189  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.34 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  35.12 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.94 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 		 336 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  35.23 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.41 
 
 		 345 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.88 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2364  ABC transporter related  34.59 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0021349  normal  0.0168897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  44.44 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  39.09 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  29.9 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  40.18 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.69 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  35.41 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  39.5 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1472  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.39 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.269585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.49 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.78 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  34.9 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  35.68 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  31.62 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  36.15 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  40.65 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  35.18 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  36.82 
 
 		 326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.5 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.12 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.29 
 
 		 449 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  40.76 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  34.85 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  34.65 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  34.74 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  34.74 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  40.76 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.77 
 
 		 332 aa  145  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  40.76 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  32.65 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  29.51 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  40.28 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  29.97 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  38.2 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  29.45 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>