More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1435 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1435  RNA pseudouridine synthase family protein  100 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.540473  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0674  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  79.76 
 
 		 252 aa  413  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363028  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0704  pseudouridine synthase  61.48 
 
 		 248 aa  315  5e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1042  pseudouridine synthase  58.63 
 
 		 254 aa  298  6e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0731  RNA pseudouridine synthase family protein  54.07 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0808  RNA pseudouridylate synthase family protein  54.07 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1298  RNA pseudouridine synthase family protein  53.25 
 
 		 250 aa  275  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0998  putative ribosomal large subunit pseudouridine synthase  54.47 
 
 		 250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1651  pseudouridine synthase  57.2 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.561342  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0447  pseudouridine synthase  52.44 
 
 		 244 aa  244  9e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0565  RluA family pseudouridine synthase  33.58 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.789528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.37 
 
 		 318 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3178  pseudouridine synthase, RluA family  29.41 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1041  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C protein  34.56 
 
 		 331 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.017285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  30.58 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1840  RluA family pseudouridine synthase  31.09 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1757  pseudouridine synthase, RluA family  31.72 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0151064  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  26.74 
 
 		 310 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.79 
 
 		 316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  34.62 
 
 		 319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1420  pseudouridine synthase, RluA family  31.3 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1339  pseudouridylate synthase  29.18 
 
 		 275 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0971  pseudouridine synthase, RluA family  33.94 
 
 		 344 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.158596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0175  RluA family pseudouridine synthase  37.7 
 
 		 296 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.408906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0906  pseudouridine synthase, RluA family  33.94 
 
 		 344 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447686  normal  0.0333397 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1802  RluA family pseudouridine synthase  30 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1063  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.78 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0781222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2921  pseudouridine synthase, RluA family  33.78 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000900564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1675  pseudouridine synthase  31.98 
 
 		 234 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.43 
 
 		 308 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2717  tRNA pseudouridine synthase C  30.04 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2824  tRNA pseudouridine synthase C  30.04 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13500  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  26.97 
 
 		 320 aa  105  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  26.32 
 
 		 320 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0509  P-protein  30.71 
 
 		 323 aa  105  6e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2650  tRNA pseudouridine synthase C  30.04 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0212  RluA family pseudouridine synthase  26.62 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.935896  normal  0.204158 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1413  pseudouridine synthase, RluA family  32.23 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0119542  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.82 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.15 
 
 		 300 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2801  RluA family pseudouridine synthase  32.89 
 
 		 335 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000617612  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.91 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2792  RluA family pseudouridine synthase  32.89 
 
 		 335 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449267  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1436  pseudouridine synthase  29.96 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0521  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.89 
 
 		 335 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1813  RluA family pseudouridine synthase  32.89 
 
 		 335 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0797823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2917  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.19 
 
 		 477 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00370322  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2862  RluA family pseudouridine synthase  32.89 
 
 		 335 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0569131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1472  pseudouridine synthase  29.96 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2192  RluA family pseudouridine synthase  34.5 
 
 		 316 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677227  normal  0.0743981 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2414  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  35.56 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2490  RluA family pseudouridine synthase  32.89 
 
 		 335 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000151813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2643  pseudouridylate synthase  30.52 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998826 
 
 
-
 
NC_002978  WD0415  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C, putative  32.82 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1162  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.7 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0658766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  31.8 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4224  pseudouridine synthase, RluD  34.06 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  32.86 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1708  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.31 
 
 		 477 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127697  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0018  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (rRNA-uridine isomerase D)  34.52 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  28.31 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1442  pseudouridine synthase  29.96 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0591  RluA family pseudouridine synthase  31.4 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0464018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0047  pseudouridine synthase, RluD  30.17 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.69 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3759  pseudouridine synthase  36.02 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  26.09 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  31.12 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0819  RluA family pseudouridine synthase  30.77 
 
 		 353 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0956515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  28.32 
 
 		 306 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  28.06 
 
 		 306 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3169  pseudouridylate synthase  30.73 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.21 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2087  RluA family pseudouridine synthase  28.62 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.29 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002742  tRNA pseudouridine synthase C  33.33 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.766432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3289  pseudouridine synthase  30.24 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.629665  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2844  pseudouridine synthase, RluD  34.88 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  29.07 
 
 		 325 aa  101  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2503  RluA family pseudouridine synthase  35.82 
 
 		 319 aa  101  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.721496  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  31.6 
 
 		 541 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1600  pseudouridine synthase, RluA family  28.89 
 
 		 525 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220651  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2175  pseudouridylate synthase  28.28 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  25.45 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  32.39 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0774  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.07 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1721  pseudouridine synthase, RluD  31.6 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2677  pseudouridine synthase, RluA family  32.72 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  28.32 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1220  ribosomal pseudouridine synthase  27.6 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1348  RluA family pseudouridine synthase  31.63 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.628416  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2903  RluA family pseudouridine synthase  27.98 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413037  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  25.9 
 
 		 402 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1370  pseudouridine synthase, RluD  27.09 
 
 		 352 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  25.9 
 
 		 402 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1262  pseudouridylate synthase  28.86 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.308846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1196  pseudouridine synthase, RluA family  32.72 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  25.9 
 
 		 402 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3108  pseudouridine synthase  30.28 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0303  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.66 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00443703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>