More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0808 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0808  RNA pseudouridylate synthase family protein  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0731  RNA pseudouridine synthase family protein  99.2 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1298  RNA pseudouridine synthase family protein  98.4 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0998  putative ribosomal large subunit pseudouridine synthase  68.8 
 
 		 250 aa  350  1e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1435  RNA pseudouridine synthase family protein  54.07 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.540473  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0674  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  54.88 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363028  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0704  pseudouridine synthase  56.38 
 
 		 248 aa  274  9e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1042  pseudouridine synthase  52.63 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1651  pseudouridine synthase  47.06 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.561342  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0447  pseudouridine synthase  45.57 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  31.22 
 
 		 322 aa  95.5  7e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl387  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase  28.7 
 
 		 311 aa  92  8e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.319286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0565  RluA family pseudouridine synthase  28.14 
 
 		 306 aa  92  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.789528  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf515  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.8 
 
 		 298 aa  91.3  1e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  31.53 
 
 		 305 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2414  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  28.57 
 
 		 290 aa  90.5  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0929  pseudouridine synthase  31.84 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2921  pseudouridine synthase, RluA family  29.52 
 
 		 341 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000900564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1875  RluA family pseudouridine synthase  29.1 
 
 		 317 aa  88.6  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.763374  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0345  pseudouridine synthase  28.24 
 
 		 226 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1429  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  25 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.22 
 
 		 316 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1708  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.85 
 
 		 477 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3178  pseudouridine synthase, RluA family  26.79 
 
 		 295 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0819  RluA family pseudouridine synthase  27.88 
 
 		 353 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0956515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1063  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.35 
 
 		 323 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0781222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1413  pseudouridine synthase, RluA family  31.89 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0119542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2644  pseudouridine synthase  27.41 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0988  pseudouridine synthase  31.97 
 
 		 270 aa  85.5  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1840  RluA family pseudouridine synthase  29.9 
 
 		 304 aa  85.5  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1115  pseudouridine synthase, RluA family  28.98 
 
 		 321 aa  85.5  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.494763 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  29.32 
 
 		 319 aa  85.5  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1379  pseudouridine synthase, RluA family  26.39 
 
 		 370 aa  85.1  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2801  RluA family pseudouridine synthase  28.36 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000617612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0521  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.36 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1813  RluA family pseudouridine synthase  28.36 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0797823  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2094  pseudouridine synthase, RluD  27.05 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2792  RluA family pseudouridine synthase  28.36 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449267  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2087  RluA family pseudouridine synthase  25.89 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2862  RluA family pseudouridine synthase  28.36 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0569131  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1358  pseudouridine synthase, RluA family  25.69 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364414  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  26.27 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2175  pseudouridylate synthase  25.89 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0878  pseudouridine synthase RluA family  26.81 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.936233  normal  0.697349 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1521  RluA family pseudouridine synthase  27.27 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2490  RluA family pseudouridine synthase  28.36 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000151813  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  28.29 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2917  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.35 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00370322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  25.53 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  25.09 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1777  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  27.4 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00553261  decreased coverage  0.000101871 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1220  ribosomal pseudouridine synthase  27.27 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2192  RluA family pseudouridine synthase  28.5 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677227  normal  0.0743981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  27.44 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2087  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  29 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000349962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0992  RluA family pseudouridine synthase  26.99 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4224  pseudouridine synthase, RluD  28 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1241  RluA family pseudouridine synthase  27.92 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01518  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.28 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1070  RluA family pseudouridine synthase  26.99 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0527141  normal  0.0360601 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0988  RluA family pseudouridine synthase  26.99 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.46 
 
 		 318 aa  82  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0632  pseudouridine synthase, RluD  26.99 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1112  RluA family pseudouridine synthase  26.99 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1196  pseudouridine synthase, RluA family  33.15 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1491  pseudouridine synthase, RluA family protein  31.96 
 
 		 318 aa  82  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1802  RluA family pseudouridine synthase  30.3 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1594  RluA family pseudouridine synthase  29.9 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260553  normal  0.0130241 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0375  RluA family pseudouridine synthase  27.38 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000429003  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2148  pseudouridine synthase  36.14 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3296  pseudouridine synthase  26 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  26.12 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3353  RNA pseudouridine synthase family protein  27.82 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0415  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C, putative  28.27 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0774  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.95 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0916  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2574  pseudouridine synthase, RluA family  26.39 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0131416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  28.26 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1014  pseudouridine synthase  29.79 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2301  pseudouridine synthase, RluD  30.33 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  26.29 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  27.75 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1620  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.38 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00181118  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1460  pseudouridine synthase  27.41 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  25.22 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2390  pseudouridine synthase, RluA family  26.67 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.837448  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  26.61 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0657  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  25.4 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2404  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.02 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2474  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.02 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0799284  normal  0.0195489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1591  pseudouridine synthase, RluA family  25.6 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  decreased coverage  0.00904495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2503  RluA family pseudouridine synthase  28.78 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.721496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0056  pseudouridine synthase  29.35 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1110  RluA family pseudouridine synthase  28.04 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2214  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  29.65 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1751  RluA family pseudouridine synthase  30.05 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000123206  normal  0.30128 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.85 
 
 		 345 aa  79  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  26.51 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0303  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.27 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00443703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0279  pseudouridine synthase  26.67 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000931063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3095  tRNA pseudouridine synthase C  25.4 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.352774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>