More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0674 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0674  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  100 
 
 		 252 aa  508  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363028  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1435  RNA pseudouridine synthase family protein  79.76 
 
 		 252 aa  413  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.540473  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0704  pseudouridine synthase  62.3 
 
 		 248 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1042  pseudouridine synthase  59.84 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1298  RNA pseudouridine synthase family protein  55.69 
 
 		 250 aa  278  8e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0731  RNA pseudouridine synthase family protein  55.28 
 
 		 250 aa  277  9e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0808  RNA pseudouridylate synthase family protein  54.88 
 
 		 250 aa  275  4e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0998  putative ribosomal large subunit pseudouridine synthase  55.28 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1651  pseudouridine synthase  55.08 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.561342  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0447  pseudouridine synthase  52.85 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.13 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0565  RluA family pseudouridine synthase  32.66 
 
 		 306 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.789528  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0415  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C, putative  32.82 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0212  RluA family pseudouridine synthase  28.26 
 
 		 298 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.935896  normal  0.204158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.33 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3178  pseudouridine synthase, RluA family  31.01 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0218  pseudouridine synthase, RluA family  27.9 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1840  RluA family pseudouridine synthase  31.62 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1041  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C protein  31.94 
 
 		 331 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.017285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  29.9 
 
 		 344 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.11 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1162  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.82 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0658766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0971  pseudouridine synthase, RluA family  34.34 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.158596 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  29.93 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1370  pseudouridine synthase, RluD  28.85 
 
 		 352 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0906  pseudouridine synthase, RluA family  34.34 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447686  normal  0.0333397 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  26.6 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0929  pseudouridine synthase  36.08 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3759  pseudouridine synthase  39.76 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3085  RluA family pseudouridine synthase  34.95 
 
 		 398 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2214  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  36.41 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0774  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.48 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  26.24 
 
 		 306 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  32.33 
 
 		 319 aa  99.8  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0988  pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0207  pseudouridine synthase, RluA family  26.98 
 
 		 302 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1757  pseudouridine synthase, RluA family  30.4 
 
 		 346 aa  99.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0151064  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0824  RluA family pseudouridine synthase  33.94 
 
 		 317 aa  99  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2414  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  31.78 
 
 		 290 aa  99  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0047  pseudouridine synthase, RluD  29.23 
 
 		 295 aa  98.6  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  34.48 
 
 		 362 aa  98.6  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.47 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.86 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl387  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase  30.59 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.319286  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2242  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  35.94 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0303  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.63 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00443703  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0195  pseudouridine synthase, RluD  29.35 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0653986  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  26.67 
 
 		 320 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1127  pseudouridine synthase, RluD  27.1 
 
 		 396 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1802  RluA family pseudouridine synthase  34.13 
 
 		 304 aa  97.1  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0631  pseudouridine synthase  33.15 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.299089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0591  RluA family pseudouridine synthase  33.99 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0464018 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1416  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.99 
 
 		 322 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  29.5 
 
 		 305 aa  96.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0540  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  26.67 
 
 		 323 aa  96.7  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.373783  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  31.28 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1241  RluA family pseudouridine synthase  33.5 
 
 		 325 aa  96.7  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0018  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (rRNA-uridine isomerase D)  32.68 
 
 		 326 aa  96.7  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  29.57 
 
 		 541 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0509  P-protein  28.57 
 
 		 323 aa  96.7  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3353  RNA pseudouridine synthase family protein  29.18 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2503  RluA family pseudouridine synthase  35.26 
 
 		 319 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.721496  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  35.26 
 
 		 305 aa  95.9  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  33.66 
 
 		 339 aa  95.9  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1158  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  31.4 
 
 		 299 aa  95.9  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0175  RluA family pseudouridine synthase  33.65 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.408906  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1460  pseudouridine synthase  30.96 
 
 		 217 aa  95.9  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  33.03 
 
 		 300 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1675  pseudouridine synthase  30.54 
 
 		 234 aa  95.9  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1220  ribosomal pseudouridine synthase  28.23 
 
 		 323 aa  95.5  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3659  pseudouridine synthase, RluD  34.29 
 
 		 378 aa  95.5  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0657  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.65 
 
 		 320 aa  95.5  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2921  pseudouridine synthase, RluA family  33.5 
 
 		 341 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000900564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  32.18 
 
 		 399 aa  95.5  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1721  pseudouridine synthase, RluD  35.12 
 
 		 346 aa  95.5  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1063  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.11 
 
 		 323 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0781222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  25.72 
 
 		 304 aa  95.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1196  pseudouridine synthase, RluA family  28.11 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2903  RluA family pseudouridine synthase  30.85 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413037  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4224  pseudouridine synthase, RluD  33.64 
 
 		 334 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2729  pseudouridine synthase, RluA family  33.51 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000152231  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  31.41 
 
 		 322 aa  94.4  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1926  pseudouridine synthase  31.78 
 
 		 304 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  hitchhiker  0.00324235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.33 
 
 		 438 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0819  RluA family pseudouridine synthase  32.71 
 
 		 353 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0956515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0474  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.21 
 
 		 323 aa  94.7  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1348  RluA family pseudouridine synthase  30.09 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.628416  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14830  Pseudouridine synthase, RluC  33.65 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300608  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0445  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  32.88 
 
 		 322 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0704  pseudouridine synthase, RluD  32.66 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1296  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  30.28 
 
 		 322 aa  93.6  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0878  pseudouridine synthase RluA family  29.27 
 
 		 327 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.936233  normal  0.697349 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1257  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.27 
 
 		 400 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1339  pseudouridylate synthase  30.32 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0663  RluA family pseudouridine synthase  27.43 
 
 		 352 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  29.05 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1708  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.71 
 
 		 477 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4547  RluA family pseudouridine synthase  27.35 
 
 		 352 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3108  pseudouridine synthase  32.63 
 
 		 306 aa  93.2  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3169  pseudouridylate synthase  30.46 
 
 		 278 aa  93.2  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>