More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1298 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1298  RNA pseudouridine synthase family protein  100 
 
 		 250 aa  503  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0808  RNA pseudouridylate synthase family protein  98.4 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0731  RNA pseudouridine synthase family protein  98.4 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0998  putative ribosomal large subunit pseudouridine synthase  68.8 
 
 		 250 aa  352  4e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0674  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  55.69 
 
 		 252 aa  278  7e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363028  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0704  pseudouridine synthase  56.79 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1435  RNA pseudouridine synthase family protein  53.25 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.540473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1042  pseudouridine synthase  53.44 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1651  pseudouridine synthase  46.86 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.561342  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0447  pseudouridine synthase  44.58 
 
 		 244 aa  214  8e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  30.73 
 
 		 322 aa  95.1  9e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl387  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase  28 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.319286  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0345  pseudouridine synthase  28.57 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0565  RluA family pseudouridine synthase  27.38 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.789528  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf515  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  26.71 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0929  pseudouridine synthase  31.84 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2414  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  28.57 
 
 		 290 aa  90.1  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  29.73 
 
 		 305 aa  89.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1429  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  25 
 
 		 327 aa  89.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1875  RluA family pseudouridine synthase  28.57 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.763374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2921  pseudouridine synthase, RluA family  28.19 
 
 		 341 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000900564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.69 
 
 		 316 aa  86.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3178  pseudouridine synthase, RluA family  26.04 
 
 		 295 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2644  pseudouridine synthase  24.29 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1708  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.86 
 
 		 477 aa  85.5  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0819  RluA family pseudouridine synthase  27.14 
 
 		 353 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0956515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0878  pseudouridine synthase RluA family  26.26 
 
 		 327 aa  85.5  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.936233  normal  0.697349 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1521  RluA family pseudouridine synthase  27.27 
 
 		 290 aa  85.1  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1358  pseudouridine synthase, RluA family  25.23 
 
 		 303 aa  85.1  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1413  pseudouridine synthase, RluA family  30.81 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0119542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0988  pseudouridine synthase  31.56 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2175  pseudouridylate synthase  25.45 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1063  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.36 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0781222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  29.32 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2087  RluA family pseudouridine synthase  25.45 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1115  pseudouridine synthase, RluA family  28.16 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.494763 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  25.88 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1840  RluA family pseudouridine synthase  29.41 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  25.82 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2801  RluA family pseudouridine synthase  28.36 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000617612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1379  pseudouridine synthase, RluA family  25.93 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  25.49 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1813  RluA family pseudouridine synthase  28.36 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0797823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0521  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.36 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107606  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2862  RluA family pseudouridine synthase  28.36 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0569131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2792  RluA family pseudouridine synthase  28.36 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449267  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2490  RluA family pseudouridine synthase  28.36 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000151813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2917  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.36 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00370322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2192  RluA family pseudouridine synthase  27.5 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677227  normal  0.0743981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2087  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  28 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000349962  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  24.73 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1220  ribosomal pseudouridine synthase  26.48 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0992  RluA family pseudouridine synthase  26.55 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0774  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0916  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4224  pseudouridine synthase, RluD  27.5 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2094  pseudouridine synthase, RluD  26.37 
 
 		 304 aa  82  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0988  RluA family pseudouridine synthase  26.55 
 
 		 334 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3353  RNA pseudouridine synthase family protein  27.82 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01518  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  27.78 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  26.29 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3296  pseudouridine synthase  26 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  25.11 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2301  pseudouridine synthase, RluD  30.33 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0632  pseudouridine synthase, RluD  26.55 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1070  RluA family pseudouridine synthase  26.55 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0527141  normal  0.0360601 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1112  RluA family pseudouridine synthase  26.55 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1777  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  27.06 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00553261  decreased coverage  0.000101871 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1241  RluA family pseudouridine synthase  27.41 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2148  pseudouridine synthase  36.14 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2574  pseudouridine synthase, RluA family  25.83 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0131416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1594  RluA family pseudouridine synthase  29.38 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260553  normal  0.0130241 
 
 
-
 
NC_002978  WD0415  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C, putative  28.27 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0375  RluA family pseudouridine synthase  26.98 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000429003  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1802  RluA family pseudouridine synthase  29.7 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1196  pseudouridine synthase, RluA family  32.58 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1014  pseudouridine synthase  29.79 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  27.51 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1491  pseudouridine synthase, RluA family protein  31.44 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1460  pseudouridine synthase  27.41 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4054  tRNA pseudouridine synthase C  23.63 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3095  tRNA pseudouridine synthase C  22.65 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.352774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  27.16 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  24.23 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02636  tRNA pseudouridine synthase  22.65 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.908245  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0897  pseudouridine synthase  22.65 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2931  tRNA pseudouridine synthase C  22.65 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02598  hypothetical protein  22.65 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.908938  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0303  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.32 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00443703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  25.44 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0921  tRNA pseudouridine synthase C  22.65 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1591  pseudouridine synthase, RluA family  25.2 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  decreased coverage  0.00904495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3081  tRNA pseudouridine synthase C  22.65 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.495199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2935  tRNA pseudouridine synthase C  22.65 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0279  pseudouridine synthase  28.04 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000931063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0657  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  24.6 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  26.59 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2207  pseudouridine synthase  27.69 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.754235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  27.27 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2404  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.5 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2474  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.5 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0799284  normal  0.0195489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>